Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Пређи на садржај

OPN3

Уреди везе

С Википедије, слободне енциклопедије

Opsin 3 (encefalopsin, panopsin)

Identifikatori

Simboli

OPN3; ECPN

Vanjski ID

OMIM: 606695MGI: 1338022HomoloGene: 40707IUPHAR:OPN3GeneCards:OPN3 Gene

Ontologija gena
Molekularna funkcija	•aktivnost rodopsinu-sličnog receptora •receptorska aktivnost •aktivnost G-protein spregnutog fotoreceptora
Celularna komponenta	•integralno sa ćelijskom membranom •membrana •integralno sa membranom
Biološki proces	•prenos signala •signalni put G-protein spregnutog receptora •vizuelna percepcija •fototransdukcija •protein-hromofor veza •regulacija cirkadijanskog ritama •respons na stimulus

Pregled RNK izražavanja

podaci

Ortolozi

Vrsta

Čovek

Miš

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Lokacija (UCSC)

Chr 1:
239.82 - 239.87 Mb

Chr 1:
177.5 - 177.53 Mb

PubMed pretraga

[1]

[2]

OPN3, iliOpsin-3, jeprotein koji je kod čoveka kodiranOPN3genom.^[1]^[2]^[3]Alternativno splajsovanje ovog gena proizvodi višetranskriptnih varijanti, koje kodiraju različiteproteinske izoforme.

Funkcija

[уреди |уреди извор]

Opsini su članovi familijeG protein-spregnutih receptora. Osim vizuelnih opsina, sisari poseduje nekolikofotoreceptivnih ne-vizuelnih opsina koji su izraženi u tkivima izvan oka. Gen opsina-3 je u znatnoj meri izražen u mozgu itestisima, a u maloj meri i ujetri,materici,srcu,plućima, skeletalnim mišima,bubrezima, ipankreasu. Ovaj gene isto tako može da bude izražen umrežnjači. Ovaj protein poseduje kanoničke osobine fotoreceptivnih opsina.^[3]

Literatura

[уреди |уреди извор]

^Blackshaw S, Snyder SH (1999). „Encephalopsin: a novel mammalian extraretinal opsin discretely localized in the brain”.J Neurosci.19 (10): 3681—90.PMID 10234000.
^Halford S, Freedman MS, Bellingham J, Inglis SL, Poopalasundaram S, Soni BG, Foster RG, Hunt DM (2001). „Characterization of a novel human opsin gene with wide tissue expression and identification of embedded and flanking genes on chromosome 1q43”.Genomics.72 (2): 203—8.PMID 11401433.doi:10.1006/geno.2001.6469.
^^а ^б„Entrez Gene: OPN3 opsin 3 (encephalopsin, panopsin)”.

Dodatna literatura

[уреди |уреди извор]

Bonaldo MF; Lennon G; Soares MB (1997). „Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery.”.Genome Res.6 (9): 791—806.PMID 8889548.doi:10.1101/gr.6.9.791.
Halford S; Bellingham J; Ocaka L; et al. (2002). „Assignment of panopsin (OPN3) to human chromosome band 1q43 by in situ hybridization and somatic cell hybrids.”.Cytogenet. Cell Genet.95 (3-4): 234—5.PMID 12063405.doi:10.1159/000059351.
Kasper G; Taudien S; Staub E; et al. (2003). „Different structural organization of the encephalopsin gene in man and mouse.”.Gene.295 (1): 27—32.PMID 12242008.doi:10.1016/S0378-1119(02)00799-0.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003).„Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.99 (26): 16899—903.PMC 139241 .PMID 12477932.doi:10.1073/pnas.242603899.
Alam NA; Gorman P; Jaeger EE; et al. (2004). „Germline deletions of EXO1 do not cause colorectal tumors and lesions which are null for EXO1 do not have microsatellite instability.”.Cancer Genet. Cytogenet.147 (2): 121—7.PMID 14623461.doi:10.1016/S0165-4608(03)00196-1.
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004).„The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).”.Genome Res.14 (10B): 2121—7.PMC 528928 .PMID 15489334.doi:10.1101/gr.2596504.
Gregory SG; Barlow KF; McLay KE; et al. (2006). „The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.”.Nature.441 (7091): 315—21.PMID 16710414.doi:10.1038/nature04727.

Transmembranski receptor:receptori spregnuti s G proteinom

Klasa A:Rodopsinu slični

Neurotransmiter

Adrenergički	α1 (A,B,D) • α2 (A,B,C) • β1 • β2 • β3
Purinski	Adenozinski (A1,A2A,A2B,A3) • P2Y (1,2,4,5,6,8,9,10,11,12,13,14)
Serotoninski	(svi osim 5-HT3)5-HT1 (A,B,D,E,F) • 5-HT2 (A,B,C) • 5-HT (4,5A,6,7)
Drugi	Acetilholin (M1,M2,M3,M4,M5) • Dopamin (D1,D2,D3,D4,D5) • Histamin (H1,H2,H3,H4) • Melatonin (1A,1B,1C) • TAAR (1,2,3,5,6,8,9)

Metaboliti i
signalni molekuli

Eikozanoidni	CysLT (1,2) • LTB4 (1,2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1,2),EP (1,2,3,4),FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi	Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1,CB2,GPR (18,55,119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1,2,3,4) • Laktat • Lizofosfatidna kiselina (1,2,3,4,5,6) • Lizofosfolipid (1,2,3,4,5,6,7,8) • Niacin (1,2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1,2,3,4,5) • Sukcinat

Peptid

Neuropeptidni

B/W (1,2) • FF (1,2) • S • Y (1,2,4,5) • Neuromedin (B,U (1,2)) • Neurotenzin (1,2)

Drugi

Anafilatoksin (C3a,C5a) • Angiotenzin (1,2) • Apelin • Bombezin (BRS3,GRPR,NMBR) • Bradikinin (B1,B2) • Hemokin • Holecistokinin (A,B) • Endotelin (A,B) • Formil peptid (1,2,3) • FSH • Galanin (1,2,3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1,2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1,1L,D,E,F,G,X1,X2,X3,X4) • Melanokortin (1,2,3,4,5) • MCHR (1,2) • Motilin • Opioidni (δ,κ,μ,Nociceptin &ζ, ali neσ) • Oreksin (1,2) • Oksitocin • Prokineticin (1,2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1,2,3,4) • Somatostatin (1,2,3,4,5) • Tahikinin (1,2,3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A,1B,2)

Razno

Orfan	GPR (1,3,4,6,12,15,17,18,19,20,21,22,23,25,26,27,31,32,33,34,35,37,39,42,44,45,50,52,55,61,62,63,65,68,75,77,78,81,82,83,84,85,87,88,92,101,103,109A,109B,119,120,132,135,137B,139,141,142,146,148,149,150,151,152,153,160,161,162,171,173,174,176,177,182,183)
Drugi	Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3,4,5,1LW,1MW,1SW,RGR,RRH) • Proteazom-aktivirani (1,2,3,4) • SREB (1,2,3)

Klasa B:Sekretinu slični

Orfan	GPR (56,64,97,98,110,111,112,113,114,115,116,123,124,125,126,128,133,143,144,155,157)
Drugi	Moždano specifični angiogenezni inhibitor (1,2,3) • Kadherin (1,2,3) • Kalcitonin • CALCRL • CD97 • Kortikotropin-oslobađajući hormon (1,2) • EMR (1,2,3) • Glukagon (GR,GIPR,GLP1R,GLP2R) • Hormon rasta • PACAPR1 • GPR • Latrofilin (1,2,3,ELTD1) • Metuzalemski protein • Paratiroidni hormon (1,2) • Sekretin • Vazoaktivni intestinalni peptid (1,2)

Klasa C:Metabotropni
glutamat /feromon

Ukus	TAS1R (1,2,3) • TAS2R (1,3,4,5,8,9,10,12,13,14,16,19,20,30,31,38,39,40,41,42,43,45,46,50)
Drugi	Kalcijum-detektujući receptor • GABA B (1,2) • Glutamatni receptor (Metabotropni glutamat (1,2,3,4,5,6,7,8)) • GPRC6A • GPR (156,158,179) • RAIG (1,2,3,4) • VNR (1,2,3,5)

Klasa F:
Frizzled /Zaglađeni

Uvojiti	Frizzled (1,2,3,4,5,6,7,8,9,10)
Zaglađeni	Zaglađeni

Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=OPN3&oldid=29226471”

Категорије:

Сакривене категорије:

[8]ページ先頭