Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Пређи на садржај
Википедија
Претрага

Jmol

С Википедије, слободне енциклопедије
Jmol
Jmol je program napisan u Javi za prikazivanje trodimenzionalnih hemijskih struktura.
Programer(i)Jmol razvojni tim
Pisano uJava
OSVišeplatformski
TipMolekulsko modelovanje
LicencaLGPL
Veb-sajtwww.jmol.org iwiki.jmol.org

Jmol je program otvorenog koda, napisan u Javi, za prikazivanje hemijskih struktura u3D,[1] za čiji rad nisu neophodni dodaci za 3D ubrzavanje.[2] Jmol prikazuje 3D reprezentacijumolekula koja se može koristi u nastavi[3] i u istraživanjima, npr. u oblastimahemije ibiohemije. Ovaj besplatni softver otvorenog koda napisan uJavi se može koristiti naWindows-u,Mac OS X,Linuksu iJuniks. Dostupna je isamostalna aplikacija, kao i komplet alata za razvoj, koji se mogu integrisati u druge Java programe, kao što suBioclipse iTaverna.

Popularno svojstvo jeapplet koji može da bude integrisan u veb stranice radi prikazivanja molekula na razne načine. Na primer, molekuli se mogu prikazati kao modeli „lopti i štapova“, „prostorno popunjavajući“ modeli, „trakasti“ modeli, etc.[4] Jmol podržava širok opsegmolekularnih formata fajlova, uklučujućiProtein Data Bank (pdb),kristalografski informacioni fajl (cif),MDL molfajl (mol), iChemical Markup Language (CML).[5]

Jmol aplet, pored drugih mogućnosti, se može koristiti kao alternativuČajm pluginu,[3] čiji je razvoj zaustavljen. Mada mnoga svojatava Jmola nisu dostupna uChime paketu, on nije zamišljen kao sveukupna zamenaChime funkcionalnosti (pre svega, skulpturnog moda). Da bis koristioChime neophodno je da se instalira plug-in i da se koristiInternet eksploreru 6.0 iliFajerfoksu 2.0 naMicrosoft Windowsu, iliNetskejp komunikatoru 4.8 naMakintoš OS9. Za upotrebu Jmol-a neophodana jeJava instalacija, koja se može koristiti na mnoštvu različitih platformi. Na primer, Jmol je potpuno funkcionalan uMozilinom fajerfoksu,Internet Eksploreru,Operi,Guglovom Hromu iSafariju.

Snimci ekrana

[уреди |уреди извор]
  • Kristalna struktura H/ACA kutije RNP iz Pyrococcus furiosus.
    Kristalna struktura H/ACA kutije RNP izPyrococcus furiosus.
  • Prikazana su dva sona mosta hemoglobinskog tetramera (hemo grupa je dole desno).
    Prikazana su dva sona mosta hemoglobinskog tetramera (hemo grupa je dole desno).
  • Fragment transkripcionog faktora TFIIIA, koji formira tri konsekutivna motiva cinkanog prsta, vezan za DNK segment.
    Fragment transkripcionog faktora TFIIIA, koji formira tri konsekutivna motiva cinkanog prsta, vezan za DNK segment.
  • Eubakterijski 70S ribozom iz Thermus thermophilus.
    Eubakterijski 70S ribozom izThermus thermophilus.

Vidi još

[уреди |уреди извор]

Reference

[уреди |уреди извор]
  1. ^Chen, Jim X. (2008), Springer, ур.,Guide to Graphics Software Tools, стр. 471,ISBN 978-1-84800-900-4 
  2. ^Willighagen, E.; Howard, M. (2007),„Fast and Scriptable Molecular Graphics in Web Browsers without Java3D”,Nature Preceedings,doi:10.1038/npre.2007.50.1 
  3. ^абHerráez, A (2006),„Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue”,Biochemistry and Molecular Biology Education,34 (4): 7,doi:10.1002/bmb.2006.494034042644 
  4. ^Herráez, A (2007), Lulu, ур.,How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, стр. 21,ISBN 978-1-84799-259-8 
  5. ^Willighagen, E (2001),„Processing CML conventions in Java”(PDF),Internet Journal of Chemistry,4 (4): 1—9 [мртва веза]

Spoljašnje veze

[уреди |уреди извор]
Portal:
Jmol nasrodnim projektima Vikipedije:
Mediji na Ostavi
Podaci na Vikipodacima
Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=Jmol&oldid=29207223
Категорије:
Сакривене категорије:

[8]ページ先頭

©2009-2026 Movatter.jp