 | |
|---|---|
| Sadržaj | |
| Opis | Onlajn portal sa otvorenim pristupom za fharmakološke informacije o svim biološkim metama lekova na recepat |
| Tipovi beleženih podataka | Nomenklatura bioloških meta, farmakološki podaci, strukture liganda |
| Organizmi | Čovek, miš, pacov |
| Kontakt | |
| Istraživački centar | Univerzitet Edinburga, UK |
| Primarni izvor | IUPHAR/BPS Vodič za farmakologiju 2016: podaci o kvantitativnim interakcijama između 1300 proteinskih meata i 6000 liganda[1] |
| Pristup | |
| Veb-sajt | www |
| Ostalo | |
| Verzije | Kontent se ažurira približno tromesečno (i.e. 2016.2 je urađeno u martu) |
| Politika kuratorstva | Manual, unutar organizacije |
IUPHAR/BPS Vodič za framakologiju je vebsajtotvorenog pristupa, koji deluje kao portal informacija obiološkim metama licenciranih lekova i drugihmalih molekula. Vodič za parmakologiju (čija standardna skraćenicapri je GtoPdb) je razvijen kao zajednički poduhvatMeđunarodne unije za bazičnu i kliničku farmakologiju (IUPHAR) iBritanskog farmakološkog društva (BPS). Ovaj projekat zamenjuje i proširuje originalnu 2009 IUPHAR bazu podataka (standardna skraćenica IUPHAR-DB). Cilj Vodiča za farmakologiju je da pruži koncizni pregled svih farmakoloških ciljeva, i da ih učini dostupnim svim članovima naučnih i kliničkih zajednica i zainterasovanog javnog mnjenja, sa linkovima ka detaljima za odabrani set ciljeva. Podaci obuhvataju farmakološke podatke, nomenklaturu ciljeva i gena, kao i obrađene hemijske informacije o ligandima. Dati su pregledi i kcomentari o svakoj familiji ciljeva, sa linkovima ka ključnim referencama.
Vodič za farmakologiju je initicajalno bio dostupan na Internetu u decembru 2011, a dodatni materijal je objavljen jula 2012. Vodič održava tim kustosa baziranih na Edinburškom univerzitetu. Vodič za farmakologiju je razvila međunarodna mreža saradnika, koja obuhvata editoreKonciznog vidiča za farmakologiju. Kao i u slučaju originalnog IUPHAR-DB, Komitet za nomenklaturu receptora i klasifikaciju lekova (NC-IUPHAR) Međunarodne unije za baznu i kliničku farmakologiju (IUPHAR), deluje kao naučni savetodavini i editoriski odbor za bazu podataka. Mreža od preko 700 specializovanih savetnika (organizovanih u ~60 potkomiteta) doprinosi ekspertizama i podacima. Trenutni principalni istraživač i nosilac stipendije GtoPdb projekta je prof.Jamie A. Davies. Razvoj i objavljivanje prve verzije GtoPdb 2012. godine je opisan u uvodniku objavljenom uBritish Journal of Pharmacology pod naslovomengl.Guide to Pharmacology.org- an update.[2] IUPHAR-DB se više ne razvija i sadržaj tog sajta je sad dostupan u Vodiču za farmakologiju (IUPHAR-DB linkovi bi trebalo da budu preusmereni).
Sledeće ciljne grupe su trenutno uvrštene u Vodič za farmakologiju:
Informacije o grupama meta su podeljene u familije na osnovu klasifikacije, sa zasebnim stranama podataka za svaku familiju. Unutar svake strane, biološke mete su organizovane u spiskove tabela, pri čemu svaka tabela sadrži proteinsku i gensku nomenklaturu mete sa vezama ka bazama podataka genske nomenklature. Odabrani ligandi su navedeni zajedno sa vrednostima njihovih aktivnosti na datoj meti, uključujući agoniste, antagoniste, inhibitore i radioligande. Farmakološki podaci i reference su dati, i za svaki ligand je naveden hiperlink ka stranici liganda koja sadrži nomenklaturu i hemijsku strukturu ili peptidnu sekvencu, zajedno sa sinonimima i relevantnim linkovima ka bazama podataka. Vodič za farmakologiju isto tako sadrži spisak svih molekula liganda koji su uključen u sajt. Spisak je podeljen u kategorije, kao što su mali organski molekuli (uključujući sisarskemetabolite,hormone ineurotransmitere), sintetičke organske molekule,prirodne produkte,peptide, neorganske molekule iantitela. Kompletan spisak svih odobrenih lekova koji su uvršteni u vebsajt je takođe dostupan sa spiska liganda. U toku je proširenje Vodiča za farmakologiju kojim se unose klinički podaci o metama i ligandima, kao i obrazovni resursi.
Funkcije pretrage vebsajta obuhvataju brze i napredne opcije pretrage, i pretrage receptora i liganda, uključujući podršku za strukture liganda koristeći hemijske strukture. Druga svojstva su vesti 'vrućih tema' i spisak nedavno definisanih parova receptora i liganda.
Vodič za farmakologiju obuhvata onlajn bazu podataka otvorenog pristupaKonciznog vodiča za farmakologiju, koji se ranije zvao "Vodič za receptore i kanale"[3] Ona je dostupna u HTML, PDF i štampanom formatu. Štampani pregled ove onlajn baze podataka je objavljen kaoKoncizni vodič za farmakologiju 2015/2016,[4] u obliku serije članaka koji su polugodišni dodaci uBritish Journal of Pharmacology.
Vodič za farmakologiju sadrži linkove na niz relevantnih resursa širom stranica o metama i ligandima. To važi za koncizne, kao i detaljne preglede. Mnogi od tih resursa održavaju recipročne linkove na relevantne strane Vodiča za frmakologiju.
.PMID 26464438.doi:10.1093/nar/gkv1037. .PMID 23003568.doi:10.1111/j.1476-5381.2012.02141.x. 
Podaci na Vikipodacima