Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Пређи на садржај
Википедија
Претрага

EcoRI

С Википедије, слободне енциклопедије
EcoRI
Kristalografska struktura restrikcione endonukleaze EcoRI bez DNK
Identifikatori
SimbolEcoRI
PfamPF02963
InterProIPR004221
SCOP1na6
SUPERFAMILY1na6
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB;PDBe;PDBj
PDBsumstructure summary
EcoRI mesto prepoznavanja sa obrascom presecanja označenim zelenom linijom
EcoRI kristalna struktura. Dimer vezan za DNK (1ckq​)[1]

EcoRI jeendonukleazni enzim izolovan iz sojevaE. coli. On je deorestrikciono modifikacionog sistema.

EcoRI se koristi kaorestrikcioni enzim u molekularnoj biologiji. On kreiralepljive krajeve sa prepustima na5' krajevima. Sekvenca nukleinske kiseline gde enzim preseca je GAATTC, što je komplementarno sa sekvencom CTTAAG. Ovi krajevi surotaciono simetrični.

Struktura

[уреди |уреди извор]

Primarna struktura

[уреди |уреди извор]

Poput mnogihrestrikcionih endonukleaza, EcoRI sadrži PD..D/EXK motiv unutar svog aktivnog mesta. On se tipično koristi za izolaciji i restrikciju bakterijskeplazmidne DNK. U EcoRI ovaj motiv se sastoji od ostataka P90, D91, E111, A112, K113(2)1.

Tercijarna i kvaternarna struktura

[уреди |уреди извор]

Ovaj enzim jehomodimer podjedinica sa 31 kD, koje sadrže globularne domene sa α/β arhitekturom. Svaka podjedinica sadrži petlju izvan globularnog domena koja se obavija oko DNK pri vezivanju..[2][3]

EcoRI je kokristalisan sa sekvencom koju normalno preseca. Taj kristal je korišten za rešavanje strukture kompleksa1QPS​. Rešena kristalna struktura pokazuje da su podjedinice enzimahomodimeri koji simetrično interaguju sa DNK.[2] U kompleksu, dvaα-heliksa sa svake podjedinice zajedno formiraju heliksni svežanj.[4] Na interagujućim heliksima su ostaci Glu144 i Arg145, koji formiraju prsten putem kojeg dva aktivna mesta enzima komuniciraju.[5]

Reference

[уреди |уреди извор]
  1. ^A. Grigorescu, M. Horvath, P. A. Wilkosz, K. Chandrasekhar and J. M. Rosenberg (2004).„The Integration of Recognition and Cleavage: X-Ray Structures of Pre-Transition State Complex, Post-Reactive Complex, and the DNA-Free Endonuclease”.Nucleic Acids and Molecular Biology.14: 137—177.doi:10.1007/978-3-642-18851-0_6. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)[мртва веза]
  2. ^абPingoud, A., Jeltsch, A. (2001).„Structure and function of type II restriction endonucleases”.Nucl. Acids Res.29 (18): 3705—3727.PMC 55916Слободан приступ.PMID 11557805.doi:10.1093/nar/29.18.3705. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)
  3. ^Kurpiewski, M. R., Engler, L. E., Wozniak, L. A., Kobylanska, A., Koziolkiewicz, M., Stec, W. J, Jen-Jacobson, L (2004). „Mechanisms of coupling between DNA recognition and catalysis in EcoRI endonucleases”.Structure.12: 1775—1788.PMID 15458627.doi:10.1016/j.str.2004.07.016. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)
  4. ^Bitinaite, J., D. A. Wah, Aggarwal, A. K., Schildkraut, I. (1998).„FokI dimerization is required for DNA cleavage”.Proc Natl Acad Sci U S A.95 (18): 10570—5.PMC 27935Слободан приступ.PMID 9724744.doi:10.1073/pnas.95.18.10570. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)
  5. ^Kim, Y. C., Grable, J. C., Love, R., Greene, P. J., Rosenberg, J. M. (1990). „Refinement of Eco RI endonuclease crystal structure: a revised protein chain tracing”.Science.249 (4974): 1307—1309.PMID 2399465.doi:10.1126/science.2399465. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)

Literatura

[уреди |уреди извор]

Vidi još

[уреди |уреди извор]

Spoljašnje veze

[уреди |уреди извор]
  • Eco-RI наUS National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)


Teme
Tipovi
Portali:
Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=EcoRI&oldid=27558837
Категорије:
Сакривене категорије:

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp