Alfa ravan (alfa naborana ravan ilipolarna naborana ravan ) je hipotetičkasekundarna struktura proteina , koji su predložiliLajnus Poling iRobert Kori 1951 .[ 1] [ 2] [ 3] Paternvodoničnog vezivanja u alfa ravni je sličan sa paternombeta ravni , ali je orijentacijakarbonilnih iamino grupa upeptidnim jedinicama osobena; sve karbonilne grupe se orijentisane u istom smeru, i sve amino grupe u suprotnom smeru ravni. Stoga alfa ravan poseduje inherentno razdvajanjeelektrostatičkog naelektrisanja , pri čemu jedna ivica ravni izlaže negativno naelektrisane karbonilne grupe, a suprotna ivica pozitivno naelektrisane amino grupe. Za razliku odalfa heliksa ibeta ravni , za konfiguraciju alfa ravni nije neophodno da sviaminokiselinski ostaci leže unutar istog regionadiedralnih uglova ; umesto toga, alfa ravan sadrži ostatke sa naizmeničnim diedralnim uglovima tradicionalnih desnorukih (αR ) i levorukih (αL ) heliksinih regionaRamačandranovog prostora .
Mada se alfa ravan veoma retko sreće u prirodnimproteinskim strukturama , postoje spekulacije po kojima ona učestvuje u amiloidnoj bolesti.[ 4] Primenommolekulsko dinamičkih simulacija je utvrđeno da je alfa ravan jedna od stabilnih formiamiloidogenih proteina.[ 5] Ona je takođe nađena međukristalografskim strukturama dezajniranih peptida.[ 4]
^ L, PAULING; COREY, R. B. (1951).„The pleated sheet, a new layer configuration of polypeptide chains” .Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America .37 (5): 251—256.Bibcode :1951PNAS...37..251P .PMC 1063350 .PMID 14834147 .doi :10.1073/pnas.37.5.251 . ^ Pauling, Linus; Corey, Robert B. (1951).„The Structure of Feather Rachis Keratin” .Proceedings of the National Academy of Sciences .37 (5): 256—261.Bibcode :1951PNAS...37..256P .PMC 1063351 .PMID 14834148 .doi :10.1073/pnas.37.5.256 . ^ Pauling, L.; Corey, R. B. (1951).„Configurations of Polypeptide Chains with Favored Orientations Around Single Bonds: Two New Pleated Sheets” .Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America .37 (11): 729—740.Bibcode :1951PNAS...37..729P .PMC 1063460 .PMID 16578412 .doi :10.1073/pnas.37.11.729 . ^а б Daggett, Valerie (2006). „α-Sheet: The Toxic Conformer in Amyloid Diseases?”.Accounts of Chemical Research .39 (9): 594—602.PMID 16981675 .doi :10.1021/ar0500719 . ^ Armen, Roger S.; Demarco, Mari L.; Alonso, Darwin O. V.; Daggett, Valerie (2004).„Pauling and Corey's α-pleated sheet structure may define the prefibrillar amyloidogenic intermediate in amyloid disease” .Proceedings of the National Academy of Sciences .101 (32): 11622—11627.Bibcode :2004PNAS..10111622A .PMC 511030 .PMID 15280548 .doi :10.1073/pnas.0401781101 .
Sekundarna struktura proteina Aminokiseline B bsyn : dnk (repl ,cycl ,reco ,repr ) · tscr (fact ,tcrg ,nucl ,rnat ,rept ,ptts ) · tltn (risu ,pttl ,nexn ) · dnab ,rnab /runp · stru (domn ,1° ,2° ,3° ,4° )