Vojislav Koshtunica u zgjodh Kryeministër iSerbisë më 3 mars 2004, pas zgjedhjeve parlamentare të parakohshme më 28 dhjetor 2003, në të cilat asnjë prej partive konkurrente nuk fitoi mbështetje të mjaftueshme për të qeverisur e vetme. Qeveria e pakicës, e formuar pas disa javë bisedimesh aleancash, përbëhet nga anëtarë të Partisë konservatore Demokratike të Serbisë të Koshtunicës (DSS), G17 Plus liberale dhe Lëvizja e Ringjalljes Serbe dhe koalicioni Serbia e Re. Ajo gjithashtu mbështetet nga Partia Socialiste e Serbisë e ish-presidentit jugosllav Sllobodan Millosheviq.
Pas zgjedhjeve parlamentare në dhjetor 2003, në të cilin DSS doli si partia më e madhe pro-BE, Koshtunica u bëkryeministër në mars 2004, megjithëse me mbështetjen ePartisë Socialiste të Serbisë. Megjithatë, si rezultat i shfaqjes së keqe e kandidatit presidencial Marsicanin Dragan në zgjedhjet presidenciale serbe, 2004, Koshtunica njoftoi se zgjedhjet e reja parlamentare duhet të pritet deri në fund të vitit vetëm pas miratimit të një kushtetute të re.
Në 15 maj 2007, pas një krize të shkurtër në koalicionin e tij, ai u betua për mandatin e tij të dytë si kryeministër.
Më 25 shkurt 2008, Koshtunica kërkoi që Shtetet e Bashkuara të heqin dorë nga njohja e saj e Kosovës, duke paralajmëruar se "nuk do të ketë stabilitet derisa të anulohet shteti i rremë".
Më 8 mars 2008, Koshtunica, si kryeministër i Serbisë, bëri thirrje për zgjedhje të reja më 11 maj pas rënies së koalicionit të partisë së tij me Partinë Demokratike mbi marrëdhëniet me Bashkimin Evropian dhe shpalljen e njëanshme të pavarësisë së Kosovës.[3]