Katolicizmi u soll nga kolonistët spanjollë dhe gradualisht u bë feja dominuese në Porto Riko.Dioqezat e para në Amerikë, duke përfshirë atë të Porto Rikos, u autorizuan ngaPapa Julius II në 1511. Në 1512, priftërinjtë u krijuan për kishat famullitare. Deri në vitin 1759, kishte një prift për çdo kishë. Një Papë,Gjon Pali II, vizitoi Puerto Rikon në tetor 1984. Të gjitha bashkitë në Porto Riko kanë të paktën një kishë katolike, shumica e të cilave janë të vendosura në qendër të qytetit oseshesh .
Protestantizmi, i cili u shtyp nën regjimin katolik spanjoll, është rishfaqur nën sundimin e Shteteve të Bashkuara, duke e bërë Porto Rikon bashkëkohore më ndërkonfesionale se në shekujt e mëparshëm, megjithëse katolicizmi vazhdon të jetë feja dominuese.
Katedralja e San Juan, e ndërtuar midis 1535 dhe 1802.
