Det babylonske fangenskap brukes i kirkehistorien som en betegnelse påpavenes opphold i den franske byenAvignon i årene 1309–1377.

I 1309 blepavestolen på grunn av de politiske maktforholdene flyttet tilFrankrike og Avignon. Paven ble knyttet til og avhengig av den franske kongen. Alle de sju pavene i Avignontiden var franskmenn.

Betegnelsen «pavestolens babylonske fangenskap» eller «eksil» henviser tilAndre kongebok iDet gamle testamente og fortellingen om jødefolkets fangenskap eller eksil i Babylon etter kongNebukadnesar IIs erobring og ødeleggelse avJerusalem og templet i 586 fvt. Eksilet varte i nesten femti år, til 538 fvt.