Guillaume Farel var en fransk teolog, og en av hovedaktørene bak innføringen avreformasjonen iSveits.

Farel kom i 1508 til universitetet i Paris, og ble magister i 1517. Kort etter sluttet han seg til reformasjonen. På grunn av forfølgelser dro han i 1521 til Meaux, og i 1523 forlot han Frankrike. Han virket med stor kraft som propagandist og reformator iStrasbourg og flere byer i Sveits.

I 1534 kom han tilGenève, der han året etter seiret ved en stormfull offentligdisputas som ble etterfulgt avbilledstorm i kirkene og avskaffelse av den katolske messe. Tilstanden ble snart kaotisk, og Farel maktet ikke å skape orden.Jean Calvin kom i 1536 til byen på gjennomreise. Farel bønnfalte ham om å bli der, og Calvin ble hans medarbeider. De to reformatorene gjorde seg snart forhatt og ble begge forvist fra Genève i 1538. Calvin ble kalt tilbake i 1541, mens Farel ble i Neuchâtel til sin død og stod derfra i forbindelse med Calvin.