Custer ledet i 1866–1871 somoberstløytnant operasjonene mot urbefolkningen iKansas,Nebraska ogColorado, blant annetmassakren avcheyennene vedWashita River i 1868. Denne perioden skildret han i bokenMy Life on the Plains (1874). Fra 1873 deltok Custer i krigen motdakotaene (sioux), og gikk vedLittle Bighorn River iMontana med fem kavalerikompanier mot dakotaenes hovedstyrke ledet avSitting Bull ogCrazy Horse. Her falt han med alle sine menn.

Custers eventyrlige karriere og hans fall i et av de mest omtalte slag i amerikansk historie, har gitt ham en nærmest legendarisk stilling. En hest, Comanche, var den eneste som overlevde slaget ved Little Bighorn, og i flere år ble den sadlet og deltok i kavaleriets parader.

Custer har også vært myteomspunnet i filmer og bøker. Den mest kjente filmen om Custer er kanskjeThe Santa Fe Trail (1940), medRonald Reagan som Custer ogErrol Flynn som Jeb Stuart. Andre filmatiseringer erLittle Big Man (1970), med Robert Mulligan som en noe forskrudd Custer; samt de mer ordinæreLittle Big Horn (1951) med Beau Bridges ogCuster of the West (1967) medRobert Shaw.

• den amerikanske urbefolkningen
• Crazy Horse
• Sitting Bull