Scheele tolket kjemiens resultater på grunnlag avflogistonteorien, somLavoisier i Scheeles levetid viste var feil. Scheele lot seg ikke overbevise av Lavoisiers resultater, og han, som Bergman, forble tro mot flogistonteorien i hele sitt liv. Han fremstilte mange nye grunnstoffer og forbindelser, men fordi han ikke var en forkjemper for de nye teoriene, kom han ofte for sent til å publisere sine resultater. Først ettertiden har gitt ham full kreditt.

Scheele var en fremragende eksperimentator som under til dels vanskelige forhold gjorde betydningsfulle oppdagelser. Han oppdaget grunnstoffeneoksygen (førPriestley),klor (førDavy),barium (før Davy),mangan (førGahn) ogwolfram (før de Elhuyar). Videre gjorde han viktige undersøkelser overfosfor ogfosforsyre, oppdagetflussyre,silisiumtetrafluorid, hydrogenpolysulfid ogarsensyre.

Scheele oppdaget også flere organiske forbindelser, blant annetvinsyre,oksalsyre,melkesyre,urinsyre,blåsyre,sitronsyre,eplesyre,pyrogallol ogglyserol. Han viste at gasser adsorberes avtrekull, at mineralsyrer katalyserer dannelsen avestere fra organiske syrer og at lyset virker inn påsølvklorid.

Scheele ble innvalgt i vitenskapsakademiet i Uppsala i 1775. Til tross for mange tilbud om betydelige stillinger i utlandet forble han ved apoteket i Köping til sin død.

• kjemiens historie