Windows 2000 je v linijo NT uvedel veliko novosti izWindows 98, kot so Posodobitev namizja sistema Windows (Windows Desktop Update),Outlook Express, NetMeeting, podpora zaFAT32, Windows Driver Model,Windows Media Player itd.
Raziskovalec (Windows Explorer) je bil izboljšan v več pogledih. V levem podoknu so prikazane podrobnosti o izbrani datoteki in za nekatere vrste tudi njen predogled. Bil je prvi, ki je v sistemih NT predstavil Active Desktop. možnost, Videz in delovanje map je mogoče prilagoditi s predlogamiHTML (to možnost so izkoriščali računalniški virusi).
Microsoft je posodobil svoj podatkovni sistem NTFS, ki je prinesel diskovne kvote in druge novosti.
Windows 2000 predstavil Logical Disk Management (logično upravljanje diska):
- Preprost disk - disk s prostorom na enem disku.
- Združeni diski - funkcija, pri kateri se do 32 diskov obnaša kot en sam disk. To poveča velikost diska, ne pa tudi učinkovitosti delovanja. V primeru, da kateri od diskov spodleti, se izgubijo vsi podatki. To je sistem JBOD, ne RAID-1.
- Progasti diski - znan tudi kot RAID-0. Podatke shrani na diskih vprogah. To omogoča hitrejše delovanje, saj se uporaba diskov porazdeli enakomerno po diskih.
Izboljšana je uporabnost Windows 2000 za uporabnike s posebnimi potrebami.
- Preklopni signali - Windows predvaja zvok, ko je pritisnjenCAPS LOCK,NUM LOCK aliSCROLL LOCK.
- Zaslonska tipkovnica - na zaslonu se pojavi virtualna tipkovnica, na katero lahko klikamo z miško ali igralno palico.
- Povečevalno steklo - poveča del zaslona okoli miškinega kazalca.
- Pripovedovalec - bralnik, ki temelji na Speech API.
- Visokokontrastna tema - za slabovidne uporabnike.
