Gondvana je nastala po razločitvi od pracelinePangeje v začetnem obdobjujure pred okrog 200 milijoni let. Ostali kontinenti, Severna Amerika inEvrazija so bili v tem času še spojeni in so tvorili severno velecelino,Lavrazijo.
Čeprav se je središče Gondvane nahajalo na področju današnje Antarktike (na samem juguZemlje), je bilo podnebje zmerno. V časumezozoika so bile povprečne globalnetemperature višje od današnjih. Gondvana je bila milijone let dom mnogimrastlinskim inživalskim vrstam.
Velecelina se je pričela razdeljevati v pozni juri pred okrog 160 milijoni let, ko se je odcepila Afrika in se počasi oddaljevala na sever. Naslednji ogromni blok, ki se je odcepil, je bila Indija (v zgodnjikredi, pred 125 milijoni let). Nova Zelandija se je odlomila pred okrog 80 milijoni let, samo 15 milijonov let pred masovnim izumrtjem na meji med kredo interciarjem, ki je izbrisalo okrog 50 % vseh bioloških vrst na planetu (med katerimi so najbolj poznanidinozavri).
Med terciarjem (obdobje razvojasesalcev) se je kontinent Avstralija-Nova Gvineja začel postopno oddaljevati in se pomikati severneje (pred 55 milijoni let), hkrati pa se je rotiral okrog svoje osi in s tem za nekaj časa ohranjal vez z Gondvano.
Pred okrog 45 milijoni let se jeIndijska podcelina dotaknilaAzije in z narivanjem na azijsko ploščo pričela formiratiHimalajsko gorstvo. V približno enakem času se je najjužnejši del Avstralije (današnjaTasmanija) končno oddvojil od današnje Antarktike in prvič omogočil pretokoceanskihtokov med kontinentoma. To je povzročilo podnebne spremembe, ki so se začele kazati v obliki suše in znižanja temperatur na obeh kopenskih masah.
Veliko pomembnejši dogodek med spremembami podnebja Zemlje je bila odcepitev Južne Amerike v obdobjuoligocena, pred verjetno 30 milijoni let. Z odpiranjemDrakeovega preliva je izginila zapora, ki je preprečevala vdor hladnih voda Južnega oceana v topletropske vode. Zaradi mešanja voda je nastal hladni cirkumpolarni tok, Antarktika pa je postal to, kar je še danes: hladna celina, ki je vklenila velik del svetovne zaloge vode. Povprečne temperature morij so se spustile za 10 stopinj Celzija, podobno pa se je ohladilo tudi celotno svetovno ozračje.
Pred 15 milijoni let, v času, ko je Nova Gvineja začela trkati ob Azijo in še enkrat pričela z dvigovanjem gorstev, se je Južna Amerika spojila s Severno Ameriko prekopanamske ožine. S tem je bilo prekinjeno kroženje tople oceanske vode in vzrok za nastanekArktike.
Gondvano je poimenoval raziskovalecEduard Suess po indijski regijiGondwana, kjer so bila najdena geološka obeležja stare veleceline.