 | |||||||||
| Molekulska struktura PDZ domena uključujući ljudski GOPC (Goldži-vezani PDZ protein koji sadrži motiv upredene zavojnice) | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | PDZ | ||||||||
| Pfam | PF00595 | ||||||||
| InterPro | IPR001478 | ||||||||
| SMART | PDZ | ||||||||
| PROSITE | PDOC50106 | ||||||||
| SCOP | 1lcy | ||||||||
| Superfamilija | 1lcy | ||||||||
| |||||||||
PDZ domen je zajedničkistrukturni domen sa 80-90aminokiselina koji je nađen kodsignalnihproteinabakterija,kvasca,biljki,virusa[1] iživotinja.[2]PDZ jeakronim formiran kombinovanjem prvih slova imena tri proteina — PSD95 (engleski:post synaptic density protein), DlgA (engleski:Drosophila disc large tumor suppressor), i zo-1 (engleski:zonula occludens-1 protein) — za koje su prvo otkriveno da imaju zajednički domen. PDZ domeni su se ranije nazivaliDHR (Dlg homolognim regionom)[3] iliGLGF (glicin-leucin-glicin-fenilalanin) domenima. Ti domeni pomažu vezivanjetransmembranskih proteina zacitoskelet i drže na okupu signalne komplekse[4].
PDZ domeni imaju sposobnost vezivanja za kratki regionC-terminusa drugih specifičnih proteina. Ti kratki regioni se vezuju za PDZ domen putem augmentacije beta ravni. Beta ravan PDZ domena se uvećava dodatkom dodatnog beta lanaca iz vezanog proteina.[5]
PDZ domeni su nađeni kod više hiljada poznatih proteina[6] Ti proteini su široko rasprostranjeni kod eukariota i eubakterija,[7] dok ima veoma malo primera tih proteina kodArchaebacteria. PDZ domeni su često sa drugimproteinskim domenima i te kombinacije im omogućavaju da izvršavaju njihove specifične funkcije. Na primer za PDZ domene u PSD-95 proteinima je utvrđeno da su vezani saSH3 domenom iguanilat kinaznim domenom.