Geološki, on je jedini dio Macquarijskog grebena koji je iznad razine mora, a koji je istitnut kada seAustralijskatektonska ploča sudarila s Pacifičkom pločom. Tako je ovo jedino mjesto na svijetu gdje su se stijenezemljine kore (6 km ispod razine mora) uzdigle iznad morske površine[1], i to 250-300 metara iznad mora. Tako većinu njegove površine čine jedinstveni jastucibazalta i druge rijetke stijene.
Ekološki pripada Podarktičkom otočkom eko-područjutundri, zajedno s južnim otocima Novog Zelanda. Otok Macquarie je najveličanstveniji tijekom sezone parenja kada ga doslovno prekrije velika populacijapingvina. Otok je također rasplodno mjesto i zamorske slonove, te četiri vrstealbatrosa
Otok Macquarie je slučajno otkrioFrederick Hasselborough u srpnju 1810. godine, tijekom potrage za nova lovna područjatuljana, koji ga je prisvojio zaUjedinjeno Kralevstvo. Otok je dobio ime po tadašnjem upraviteljuNew South Walesa,Lachlanu Macquarieu. NijemacFabian Gottlieb von Bellingshausen je prvi sustavno istražio otok 1820. godine, tijekom svoje misije za ruskog caraAleksandra I. Od 1810. do 1919. godine sustavnim izlovom, populacija tuljana i pingvina na otoku je gotovo iskorijenjena, advije endemske vrste ptica neletjelica su nestale.
Od 1890. godine otok Macquarie upravno pripada Tasmaniji, a od 1902. do 1920. koncesiju na otok je imaoJoseph Hatch koji je koristio otočku populaciju pingvina za proizvodnju ulja. God. 1911. australci su osnovali meteorološku postaju, koja je napuštena 1915., da bi 1948. Austrasko antarktičko povjerenstvo osnovalo Istraživačku postaju koja je i danas aktivna, te njegovih 20 do 40 radnika predstavlja jedino stanovništvo na otoku.
Od 1933. godine otok Macquarie je proglašen zaRezervat prirode za zaštitu ptica, a 1972. godine je postao Državnim rezervatom Tasmanije, da bi 1997. godine postaosvjetskom baštinom[2].
Dana 23. prosinca 2004. godine,potres jačine 8.1Richterove ljestvice (jedan od najjačih od kada postoje mjerenja potresa) je pogodio otok Macquarie, ali nije prouzročio ozbiljniju štetu[3].
