Gregorio Papareschi izabran je za papu na konklavi održanoj1130. dok je još stari papaHonorije II. bio živ, iako smrtno bolestan[1] na kojoj je bilo samo 9 kardinala, od kojih su većina bilifrangipani - njegovi simpatizeri. Za papu je proglašen14. februara1130. sa imenomInocent II., dan nakon smrti papeHonorija II. Njegov izbor osporili su simpatizeri njegovog rivalakardinala Pietra Pierleonia, koji su upravo Pierleonia izabrali za svog papu pod imenomAnacletus II.[2] Oni su bili dovoljno jaki i moćni da potpuno preuzmu vlast u Rimu, tako da jeInocent II. morao pobjeći uPisu, a nakon toga potražiti utočište uFrancuskoj. On je tu razvio široku aktivnost, kao i u susjednojNjemačkoj, gdje su gabiskupi i vladari držali za pravog papu.[2] UItaliju se vratio1132 nasinod uPiacenzi, sudjelovao je i na velikom sinodu uPisi1135. na kojem su bili i brojni uticajni biskupi i kardinali izŠpanjolske,Engleske,Francuske,Njemačke,Ugarske i brojnih drugih zemalja na kojem je dobio podršku kao jedini legitimni papa. NoAnacletus II. se još uvijek držao u Rimu zahvaljujući podršci moćnogRuggera II. Sicilijanskog nakon toga se samcarLotar III uputio u marš na Rim[2] ali do velikih borbi nije došlo jer jeAnacletus II. umro25. januara1138.[1], istina njegovi pristalice ponovno su izabrali novog antipapu koji se prozvaoVictor IV. ali je on ubrzo digao ruke od svega tako da jeInocent II. ponovno preuzeo rimsku papinsku stolicu.[2]
Inocenta II. zaskočio je iz zasjede kod Galluccia22. marta1139. sinRuggera II. Sicilijanskog i zarobio,Inocent II. bio je prisiljen potpisati saRuggerom Sporazum iz Mignana25. marta1139. kojim jeRuggeru priznao njegovu vlast na Siciliji, ali je to opozvao nešto prije svoje smrti1143. tako da je taj problem nasliedio njegov nasljednik papaCelestin II.