Bonifacije III. (? - 12. studeni 607.) je bio papa od19. veljače607. do12. studenog607. godine. Bio je sin Ivana Katadioka,Rimljaninagrčkog porijekla. Kaođakon je impresionirao papuGrgura Velikog, koji ga je 603. imenovao zaapocrisiariusa (pretečupapskog legata), odnosno vlastitog izaslanika nabizantskom dvoru uKonstantinopolu. Tamo se Bonifacije istakao diplomatskim vještinama, stekavši duboko povjerenje caraFoke; uspješno je, po papinom nalogu, riješio spor oko crkvene nadležnosti između episkopa Alkisona od Kasiope (na otokuKorkira) i episkopa Jovana od Aurije, koji je na taj otok sa vjernicima pobjegao pred najezdomSlavena. Kao izaslanika ga je vjerojatno koristio i Grgurov nasljednikSabinijan. Nakon Sabinijanove smrti u februaru 606. je Bonifacije izabran za njegovog nasljednika, ali je dužnost preuzeo tek za godinu dana; postoje razna tumačenja za tako dugu pauzu, a tradicionalno se objašnjava da Bonifacije nastojao biti potpuno siguran da je njegov izbor načinjen na valjan način. Kada se vratio u Rim, donio je važne reforme vezane uz izbor papi; pod prijetnjomekskomunikacije je svima zabranio da raspravljaju o imenovanju papskog nasljednika, te odredio da proces izbora novog pape ne smije početi dok ne prođu tri dana od smrti prethodnog pape.