NECTIN1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигацииПерейти к поиску
NECTIN1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов:PDBeRCSB
Список идентификаторов PDB

3ALP,3SKU,3U83,4FMF,4MYW

Идентификаторы
ПсевдонимыNECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nectin-1, PVRL1, nectin cell adhesion molecule 1
Внешние IDOMIM:600644MGI:1926483HomoloGene:2138GeneCards:NECTIN1
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме NECTIN1
Расположение в геноме NECTIN1
Локус11q23.3Начало119,623,408bp[1]
Конец119,729,200bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме NECTIN1
Расположение в геноме NECTIN1
Локус9|9 A5.1Начало43,655,281bp[2]
Конец43,743,955bp[2]
Паттернэкспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • skin of abdomen

  • skin of leg

  • mucosa of pharynx

  • body of tongue

  • gingival epithelium

  • lateral nuclear group of thalamus
Наибольшая экспрессия в
  • neural layer of retina

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • primary visual cortex

  • decidua
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники:Amigo,QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

5818

58235

Ensembl

ENSG00000110400

ENSMUSG00000032012

UniProt

Q15223

Q9JKF6

RefSeq (мРНК)

NM_203286
NM_002855
NM_032767
NM_203285

NM_021424

RefSeq (белок)

NP_002846
NP_976030
NP_976031

NP_067399

Локус (UCSC)Chr 11: 119.62 – 119.73 MbChr 9: 43.66 – 43.74 Mb
Поиск поPubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип ВикиданныхИнформация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Нектин-1 (PVRL1; CD111) —мембранный белок,нектин группымолекул клеточной адгезии, гликопротеин суперсемействаиммуноглобулинов, продукт гена человекаNECTIN1[5].

Содержание

Структура

[править |править код]

Нектин-1 состоит из 517аминокислот, молекулярная масса белковой части 57 158 Да. Нектин-1 содержит 3 внеклеточных иммуноглобулиновых доменов, трансмембранный фрагмент и цитоплазматический домен. Белок опосредуетCa2+-зависимую клеточную адгезию[5].

Функции

[править |править код]

Нектин-1 — молекула адезии, обнаруженная в широком спектре тканей, в которых она локализуется в участках межклеточных контактов, таких какадгезивные контакты вэпителии илихимические синапсы внейронах. Цитоплазматический участок белка связывается с белкомафадином, связанным сактином.

В синапсах нектин-1 взаимодействует снектином-3, причём оба белка экспрессированы в нервной ткани как на ранних этапах развития, так и в стареющем мозге. В синапсе эти белки расположены асимметрично: нектин-1 в первую очередь локализован нааксоне, а нектин-3 — надендрите.

Нектин-1 играет ключевую роль как рецептор в опосредовании входа в клетку вируса герпесаВПГ-1 за счёт взаимодействия с вирусным гликопротеином D (gD)[6].

Взаимодействия

[править |править код]

Нектин-1 взаимодействует сMLLT4.[7].

Примечания

[править |править код]
  1. 123GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000110400 -Ensembl, May 2017
  2. 123GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032012 -Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 12Entrez Gene: PVRL1 poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C; nectin) . Дата обращения: 24 января 2022. Архивировано 7 марта 2010 года.
  6. Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999).The V domain of herpesvirus Ig-like receptor (HIgR) contains a major functional region in herpes simplex virus-1 entry into cells and interacts physically with the viral glycoprotein D.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.95 (26):15700—5.doi:10.1073/pnas.95.26.15700.PMC 28107.PMID 9861033.
  7. Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (Май 1999).Nectin/PRR: An Immunoglobulin-like Cell Adhesion Molecule Recruited to Cadherin-based Adherens Junctions through Interaction with Afadin, a PDZ Domain–containing Protein.J. Cell Biol.145 (3):539—49.doi:10.1083/jcb.145.3.539.PMC 2185068.PMID 10225955.

Литература

[править |править код]
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400
Источник —https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=NECTIN1&oldid=151134939
Категории:
Скрытая категория: