CLEC4M

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигацииПерейти к поиску
CLEC4M
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов:PDBeRCSB
Список идентификаторов PDB

1K9J,1SL6,1XAR,1XPH,3JQH

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Внешние IDOMIM:605872MGI:2157942HomoloGene:129771GeneCards:CLEC4M
Расположение гена (человек)
19-я хромосома человека
Хр.19-я хромосома человека[1]
19-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC4M
Расположение в геноме CLEC4M
Локус19p13.2Начало7,763,210bp[1]
Конец7,769,605bp[1]
Расположение гена (Мышь)
8-я хромосома мыши
Хр.8-я хромосома мыши[2]
8-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC4M
Расположение в геноме CLEC4M
Локус8|8 A1.1Начало3,793,397bp[2]
Конец3,798,984bp[2]
Паттернэкспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right lobe of liver

  • germinal epithelium

  • pancreatic ductal cell

  • left adrenal cortex
Наибольшая экспрессия в
  • skin of abdomen

  • muscle of thigh

  • right lung lobe

  • skin of external ear
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники:Amigo,QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10332

170786

Ensembl

ENSG00000104938

ENSMUSG00000031494

UniProt

Q9H2X3

Q91ZX1

RefSeq (мРНК)
NM_001144904
NM_001144905
NM_001144906
NM_001144907
NM_001144908

NM_001144909
NM_001144910
NM_001144911
NM_014257
NM_214675
NM_214676

NM_133238

RefSeq (белок)
NP_001138376
NP_001138377
NP_001138378
NP_001138379
NP_001138380

NP_001138381
NP_001138382
NP_001138383
NP_055072

NP_573501

Локус (UCSC)Chr 19: 7.76 – 7.77 MbChr 8: 3.79 – 3.8 Mb
Поиск поPubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип ВикиданныхИнформация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M, лектин С-типа домен семейство 4 член M; CD299), илиL-SIGN, —мембранный белок,лектин типа С. Продукт гена человекаCLEC4M[5].

Функции

[править |править код]

Белок является мембранным белком 2-го типа. На 77%гомологичен белкуCD209. Оба белка связывают белок клеточной адгезииICAM-3 ивирусный белокHIV-1gp120. Взаимодействие сHIV-1 gp120 повышает инфекцию вирусомT-лимфоцитов. Обнаружены множественные варианты белка из-за альтернативного сплайсинга. ГенCLEC4M находится на 19p13.3 в кластере сCD209 иCD23/FCER2[6].

Относится крецепторам опознавания паттерна, участвует в периферийном иммунном ответе в печени. Может опосредовать эндоцитоз патогенов, ведущего к последующей деградации патогена в лизосомах. РецепторICAM3 и, возможно, маннозо-подобных углеводов.

Примечания

[править |править код]
  1. 123GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104938 -Ensembl, May 2017
  2. 123GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031494 -Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank (англ.) //Gene[англ.] : journal. —Elsevier, 1999. — April (vol. 228,no. 1—2). —P. 161—167. —doi:10.1016/S0378-1119(99)00004-9. —PMID10072769.
  6. Entrez Gene: CLEC4M C-type lectin domain family 4, member M . Архивировано 21 августа 2018 года.

Литература

[править |править код]
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400
Источник —https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=CLEC4M&oldid=151093872
Категории:
Скрытая категория: