Cea mai cunoscută operă de artă expusă esteLas Meninas de Velázquez. Nu doar a oferit muzeului propriile sale tablouri superbe, ci chiar a atras prin sensibilitatea sa artistică mare parte din colecția de maeștriiitalieni a muzeului.
Faimoasa picturăGuernica (pictură) dePablo Picasso a fost expusă la Prado, după revenirea acesteia în Spania, în urma restaurării democrației, dar aceasta a fost mutată laMuseo Reina Sofia unde a fost găsit un spațiu expozițional mai mare pentru imensa pânză.
Una dintre intrările în Prado este dominată de statuia din bronz a lui Diego Velázquez.
Muzeul Prado este amplasat într-o clădire construită în timpul regatului luiCarol al III-lea, parte a unui plan de urbanizare care dorea să facă dinMadrid un oraș monumental. Această pajiște (prado în spaniolă) a dat numele întregii zone (Salón del Prado, mai târziu Paseo del Prado), apoi chiar muzeului însuși, dupănaționalizare. Lucrările la construcția clădirii au fost suspendate după terminarea domniei lui Carol al III-lea și în timpulRăzboiului Spaniol de Independență, fiind reluate doar în timpul domniei nepotului său,Ferdinand al VII-lea. Structura a devenit sediulcavaleriei și a magazinului depulvere pentru trupelenapoleonice staționate la Madrid, pe durata Războiului de Independență. După detronarea regineiElisabeta a II-a în1868, muzeul a fost naționalizat și a primit numele de Museo del Prado. Clădirea găzduia colecția regală de artă, dovedindu-se însă neîncăpător. Prima extindere a muzeului a avut loc în1918.
Cea mai recentă extindere a constat în incorporarea a două clădiri (învecinate, dar nu adiacente) în structura instituțională a muzeului.Casón del Buen Retiro găzduiește din1971 majoritatea operelor de artă dinsecolul al XIX-lea. Palacio de Villahermosa găzduiește în prezentMuzeul Thyssen Bornemisza, a cărui colecții au fost inițial adunate din averi private (lucrări care nu făceau parte din colecția Statului), dar care încearcă să completeze golurile și slăbiciunile colecțiilor din Prado; Thyssen Bormisza face parte din sistemul Prado din1985.
În timpulrăzboiului civil spaniol, la recomandareaLigii Națiunilor, personalul muzeului a trimis cincizeci și trei de picturi, o sută șaizeci și opt de desene și Comoara lui Dauphin laValencia, apoi laGirona și în final laGeneva. Lucrările de artă au trebuit să fie returnate imediat după începerea celui de-al doilea război mondial, fiind încărcate în trenuri de noapte, care traversau teritoriul francez.