Termenul „Micronezia” a fost folosit pentru prima dată deJules Dumont d'Urville care a propus introducerea termenului în 1831. Înainte de această dată, termenul „Polinezia” era folosit pentru a defini totalitatea insulelor din Oceanul Pacific.
Anumite regiuni ale Microneziei au fost colonizate timpuriu deSpania, dar colonizarea totală a avut loc abia la sfârșitul secolului al XIX-lea, când teritoriile acestei regiuni erau controlate deStatele Unite ale Americii,Germania șiImperiul Britanic. În acest timp, Spania și-a vândut o parte din colonii Germaniei, iar restul le-a pierdut în războiul cu Statele Unite ale Americii din 1898.
În ziua de astăzi, mare parte din Micronezia este compusă din state independente, excepție făcând insulele Guam, Wake și Mariane de Nord, care sunt teritorii dependente de Statele Unite ale Americii.
Populația de astăzi a Microneziei formează mai multe etnii, dar toate descend și aparțin culturii microneziene. Cultura microneziană a fost una dintre ultimele culturi dezvoltate în regiune. Ea s-a dezvoltat dintr-un amestec de melanezieni, filipinezi și polinezieni. Din cauza acestui amestec, anumite etnii s-au simțit mai apropiate deMelanezia,Polinezia șiFilipine. Ca dovadă acestui fapt stă limba Yappesse.
