Organizația se concentrează asupra utilizatorului de desktop. Pentru că există multe sisteme de dezvoltare pentru X11, organizația încearcă să se asigure că diferențele nu sunt vizibile pentru utilizatori.
Cele mai folosite medii desktop pentruX,GNOME șiKDE, lucrează împreună la acest proiect. De curând freedesktop.org a publicat proiectulPortland, un set de interfețe comune pentru mediile desktop.
În trecut freedesktop.org s-a numit „X Desktop Group” și acronimul „XDG” este folosit în continuare în lucrările lor.
GTK-QT engineArhivat în, laWayback Machine., un sistem de randareGTK+ 2 care foloseșteQt pentru a desena elementele de interfață grafică, oferind programelor GTK+2 aceeași experiență în utilizare cu a aplicațiilor KDE.
Avahi, o implementare aZeroconf, incepută ca proiect al fd.o, dar va fi mutată în altundeva.