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Aregião de codificação de umgene, também conhecida e abreviada na literatura eminglês comoCDS (decodingDNAsequence), é uma porção deDNA de um gene ouRNA que codifica paraproteína.^[1] A região geralmente começa naextremidade 5' por umcodão de início e termina naextremidade 3' com umcodão de parada.

A soma total das regiões de codificação de umgenoma de um organismo é chamado seuexoma.

A região de codificação em ummRNA é ladeado pelaregião 5' não traduzida (5'-UTR) e aregião 3' não traduzida (3'-UTR).^[2] O CDS é a porção de uma transcrição de mRNA que é traduzido por umaribossoma. CDS é uma palavra-chave (chave de recurso) usada para denotar a 'sequência de codificação de proteínas' em uma tabela de recursos de um gene pelos principais bancos de dadosINSDC de sequências.^[3] Eles também lêem CDS como sequência de codificação e região de codificação.^[4]

Uma sequênciacDNA (DNA complementar) é derivado do transcrito por transcrição reversa, mas neste caso também contém asUTRs 5' e 3', as quais não são parte do CDS (são transcritas, mas não traduzidas). Um CDS iráquase sempre começar com umcodon de iniciação AUG emeucariotas e parar em um dos trêscódons de parada (UAA, UGA, UAG).

Enquanto a identificação defases de leitura aberta dentro de uma sequência de DNA é direta, não identificando sequências de codificação, porque a célula traduz apenas um subconjunto de todos as fases de leitura aberta para proteínas.^[5] Atualmente a previsão de CDS usa amostragem e sequenciamento de mRNA das células, embora ainda exista o problema de determinar quais partes de um determinado mRNA são realmente traduzidas para proteína. A previsão do CDS é um subconjunto depredição de genes, este último inclui também a previsão de sequências de DNA que codificam não só proteínas, mas também outros elementos funcionais, como genes de RNA e sequências reguladoras.

• Cadeia codogênica - A cadeia que codifica uma proteína;
• Estrutura do gene - Os outros elementos que compõem um gene;
• DNA não codificante - Partes de genomas que não codificam genes;
• RNA não codificante - Genes que não codificam proteínas, não possuem CDS.
• Mutação somática

Referências

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