Nos anos 30, o alto desenvolvimento industrial e o aumento da população da cidades fizeram dela uma das maiores e mais importantes doCáucaso. Seguindo o exemplo deMoscovo eLeningrado (actualmenteSão Petersburgo), foi decidido em1932 que o meio de transporte mais conveniente às necessidades da cidade em pleno desenvolvimento era o metropolitano, que aumentaria a mobilidade das pessoas e diminuiria o tráfego das ruas de Bacu.
À semelhança de outras cidades daURSS, os planos ficaram em suspenso devido àSegunda Guerra Mundial, para a qual foi canalizado todo o capital disponível. Após a guerra foi retomada a ideia de construir um metro em Bacu, e em1947 o projecto foi aprovado. A primeira linha tinha um comprimento aproximado de 10 km, e abriu a6 de novembro de1967. Um ano mais tarde, em1968, foi construído um novo troço de linha com 2,2 km entre as estações de28 de Maio eXá Ismail Xatai. Um novo troço entre as estações deNəriman Nərimanov eNeftçilər foi construído para servir os subúrbios da cidade. A rede prolongou-se para nordeste a partir da estação deNizami Gəncəvi em1976. A construção de estações avançou a ritmo apressado e até1986 a rede tinha já a configuração actual.
Depois da queda da URSS não houve nenhuma alteração no metro de Bacu; as limitações económicas não permitiram que as obras prosseguissem. Espera-se um investimento daUnião Europeia de vários milhões de euros para ajuda no desenvolvimento da rede. Nos últimos anos foram de adversidades para o metro e para o seu funcionamento, nomeadamente o facto de terem ocorrido dois atentados terroristas, um em1994 e outro em1995 (oficialmente foi um atentado, mas até hoje ainda não foi confirmado).
Em2015, o sistema levou a um total de 608 200 pessoas por dia em 228 vagões de metrô.[1]