Após sua fundação, que foi a fusão de dois clubes ativos no futebol francês, Olympique Lillois eSC Fives, o sucesso do Lille foi instantâneo. Logo na sua primeira participação no certame nacional, foi campeão. Ainda em 1945-46, conquistou sua primeiraCopa da França, título que conseguiria nos dois anos seguintes, estabelecendo um recorde de três conquistas consecutivas, junto aoRed Star.
Nos anos seguintes, fixou-se nas primeiras posições doCampeonato Francês, sendo vicecampeão quatro vezes seguidas. Seu segundo título veio em 1953-54, em meio a duas conquistas da Copa da França.
Assim como o sucesso, a queda foi rápida. Passou pouco mais de vinte anos alternando entre as divisões inferiores do país e a elite. Mesmo com seu retorno em definitivo, não conseguiu fazer mais boas campanhas em quaisquer competições.
No final dosanos 1990, sofreu outro rebaixamento, conseguindo voltar em1999-2000. Noséculo XXI, vem dando sinais de que seu sucesso está retornando, com três participações naLiga dos Campeões da UEFA e boas campanhas naLigue 1.
Na temporada 2010-11, foi campeão da Copa da França e do Campeonato Francês, acabando um tabu de mais de 50 anos sem os troféus. Foi a segundadobradinha da história do Lille, e apenas a terceira no futebol francês num intervalo de mais de 20 anos.
Na temporada de2020-21 o clube voltou a vencer ocampeonato francês, dez anos depois da sua última conquista. O Lille terminou o Campeonato Francês com 83 pontos, um à frente do PSG e com apenas três derrotas no torneio.