 | Esta páginacita fontes, mas quenão cobrem todo o conteúdo. Ajude ainserir referências (Encontre fontes:ABW • CAPES • Google (notícias • livros • acadêmico)).(Junho de 2021) |
Genômica(português brasileiro) ougenómica(português europeu) é um ramo dagenética que estuda ogenoma completo de umorganismo.[1] Essaciência pode se dedicar a determinar a sequência completa doDNA de organismos ou apenas ao mapeamento de uma escalagenética menor.
Como o nome indica, a genômica — junto comtranscriptômica,proteômica,metabolômica, etc — faz parte de um conjunto de ciências denominado "ômicas".
Tal termo deriva do sufixo "-oma", que significa "conjunto de", e pode ser entendido como estudo do conjunto inteiro; em grande escala.
Então, entendemos transcriptômica como o estudo do transcriptoma, do conjunto inteiro de mRNAs; proteômica como o estudo do proteoma, o conjunto completo de proteínas resultantes da expressão gênica e metabolômica como o estudo das alterações na expressão de metabólitos, pequenas moléculas orgânicas oriundas do metabolismo de certa molécula ou substância. Todos eles estão lligados pela rota "ômica", como pode ser visto pela imagem anexada.[2]
Com muita importância para este ramo da genética, existe oprojeto genoma, que propõe osequenciamento completo de genomas e envolve principalmente o sequenciamento do DNA dos organismos em questão, a montagem do modelo da sequência e a anotação.
Ver artigo principal:Sequenciamento de DNANessa fase, é feito um sequenciamento cerca de 10 ou 12 vezes maior que o tamanho do genoma do indivíduo em questão. Atualmente, o sequenciamento de genomas é feito principalmente porSequenciamento Shotgun ouPirosequenciamento.
A montagem (mais referida como assembly) se refere ao alinhamento e fusão de fragmentos de DNA para reconstruir a sequência original, geralmente utilizando softwares apropriados que combinam as sequências obtidas pelo sequenciamento (tal inferência é possível já que vários exemplares do genoma são fragmentados em pedaços de maneiras diferentes antes do sequenciamento). Isso é necessário uma vez que o sequenciamento não consegue ler o genoma inteiro de forma contínua, lendo fragmentando de 20 a 1 000 bases.
Nessa etapa é feita a extração de informações biológicas da sequência final obtida. Ela consiste em três principais etapas:
Ferramentas de anotação automática tentam realizar essas etapasIn silico, enquanto a anotação manual (curadoria) envolve especialistas e verificação experimental. Idealmente ambas as abordagens são feitas em conjunto, uma complementando a outra.
Tradicionalmente, o nível básico de anotação utilizaBLAST para encontrar semelhantes nas bases de dados e então a anotação é feita com base neles.
Ver artigo principal:MetagenômicaEnquanto a genômica se preocupa com o sequenciamento de genomas individuais, a metagenômica busca o sequenciamento do conjunto de genomas de um ambiente (o prefixo "meta" carrega a ideia de transcendência, ir além), tendo como objeto de estudo as amostras ambientais. Seu principal objetivo é entender as comunidades microbianas e seu papel ecológico.[3]
A maior agilidade na obtenção de dados genômicos possibilitou uma maior eficiência no conhecimento do papel de certos genes em impedir ou contribuir com certas doenças. Dessa forma, ela auxilia no desenvolvimento de vacinas e fármacos, exemplo disso foi o desenvolvimento dedrogas antimaláricas.
Principalmente no campo de biologia sintética, há como exemplo o uso do genoma doMycoplasmagenitaliumna síntese doMycoplasma laboratorium.
Utilizada por conservacionistas para estudar os fatores-chave envolvidos na conservação de uma espécie.[4]
