A PAN funciona como uma sociedade acadêmica agindo através de uma corporação eleita dos principais estudiosos e instituições de pesquisa. A academia, operando através de suas comissões, tornou-se um órgão científico consultivo de destaque.
Outro aspecto da academia é a sua coordenação e supervisão de numerosos (várias dezenas) institutos de pesquisa. Os institutos PAN empregam mais de 2.000 pessoas, e são financiados por cerca de um terço do orçamento do governo polonês para a ciência.