Webber wcześnie rozpoczął karierę sportową. Swoje dzieciństwo spędził jako chłopiec od piłek w pierwszoligowym zespolerugby,Canberra Raiders. Karierę w sportach samochodowych rozpoczął odkartingu. Sukcesy w ojczystym kraju pomogły mu awansować doFormuły Ford, gdzie odniósł kilka zwycięstw, wliczając wygraną wAdelaide w 1995 i trzecie miejsce na festiwalu Duckhams Formula Ford Festival wBrands Hatch, podczas jego międzynarodowego debiutu.
Jego potencjał został zauważony przez lidera Formuły Ford, Van Diemena i został on zatrudniony na sezon 1996. Ale stało się to dopiero po jego wygranej w inauguracyjnym Grand Prix Melbourne wFormule Holden.
Dzień po sukcesie na festiwalu Webber przeszedł pomyślnie testy dla zespołuAlan Docking Racing, startującego wFormule 3. W zespole tym spędził cały sezon1997. Wygrał swój czwarty w karierze wyścig w F3 na torzeBrands Hatch i w klasyfikacji zajął czwartą pozycję. Zajął także trzecią pozycję w Marlboro Masters i czwartą wGrand Prix Makau.
Jego sukcesy w Formule 3 doprowadziły do podpisania kontraktu zAMG i występach wFIA GT Championship w1998 roku. Webber był partnerem obrońcy tytułuBernda Schneidera, pomagając mu w odniesieniu pięciu wygranych, nie zdobyli jednak tytułu przegrywając o osiem sekund na torzeLaguna Seca wKalifornii.
Kontynuując współpracę z AMG, Webber rozpoczął sezon1999 jako główny kierowca swojego zespołu i z własnym samochodem. Program wyścigów zespołu w tym sezonie został zredukowany i obejmował wyścig24 Godziny Le Mans i wybrane eliminacje seriiAmerican Le Mans Series. Program został przerwany po spektakularnym locie i obrotach w powietrzu samochodu Webbera podczas czwartkowych treningów do wyścigu wLe Mans. Bolid został odbudowany do wyścigu, lecz Webber podczas sesji rozgrzewkowej rozbił się w taki sam sposób. Z obydwu wypadków udało mu się ujść bez większych obrażeń. Pięć godzin po tym zdarzeniu, podczas wyścigu, jego partner z zespołu,Peter Dumbreck doświadczył identycznego zdarzenia. Cały program Mercedesa został zawieszony, a samochody już nigdy nie wystartowały.
Webber wrócił do wyścigów bolidów o otwartym nadwoziu. Został przedstawiony swojemu rodakowi,Paulowi Stoddartowi przezEddiego Jordana i rozpoczął pracę dla zespołuEuropean Arrows Formula Racing w MistrzostwachFormuły 3000. Pomimo braku doświadczenia szybko objął prowadzenie w klasyfikacji generalnej, a ostatecznie zajął trzecią pozycję. Został tym samym najwyżej sklasyfikowanym debiutantem sezonu2000.
Po odrzuceniu kontraktu z zespołemArrows w lipcu 2000, Webber wziął udział w trzydniowych testach zespołuBenetton na torzeEstoril. Okazał się lepszy odGiancarlo Fisichelli iRalfa Schumachera. Jego osiągi zapewniły mu posadę oficjalnego kierowcy testowego w zespole w sezonie2001. W tym samym roku został wicemistrzem w MiędzynarodowejFormule 3000 w zespoleSuper Nova Racing.
W sezonie2002 rozpoczął pracę dla zespołuPaula Stoddarta,Minardi. Pomimo bardzo słabego bolidu został najlepszym debiutantem sezonu. W jego debiutanckim Grand Prix, w rodzinnej Australii, zajął piątą pozycję, zdobywając dlaMinardi pierwsze punkty od sezonu1999. Stał się tym samym jednym z czterech australijskich kierowców, którzy zdobyli punkty w Formule 1. W każdym wyścigu podczas kwalifikacji okazywał się lepszy od swoich partnerów z zespołu,Alexa Yoonga iAnthony'ego Davidsona.
W sezonie2003 został głównym kierowcą zespołuJaguar Racing. Zdobył dla zespołu 17 z 18 zgromadzonych przez nią punktów i zajął dziewiątą pozycję w klasyfikacji generalnej kierowców. Do pierwszych wyścigów sezonu2004 zakwalifikował się na szóstej i drugiej pozycji, nie zdołał ich jednak ukończyć. Ostatecznie uplasował się na trzynastej pozycji w klasyfikacji z siedmioma zdobytymi punktami.
W sezonie2005 został kierowcą zespołuWilliams F1, jego partnerem zostałNick Heidfeld. Jego debiut w zespołu, który przypadł naGrand Prix Australii był udany, zajął 5 pozycję. W dalszej części sezonu Webbera wGrand Prix Monako zajął trzecie miejsce, co było jego pierwszym podium w karierze. Ostatecznie zajął jednak dziesiąte miejsce w klasyfikacji końcowej będąc przed swoim zespołowym partneremNickiem Heidfeldem, który doznał kontuzji. W kolejnym roku ponownie reprezentował barwy zespołu Williams. Tym razem jego partnerem był debiutantNico Rosberg. Australijczykowi udało się zdobyć siedem punktów. Głównym tego powodem były zawodne silnikiCoswortha. Sezon ukończył na czternastej pozycji w klasyfikacji generalnej.
Odsezonu 2007 reprezentuje barwy zespołuRed Bull Racing. Debiutancki rok w austriackim zespole osiągnął trzecie miejsce podczasGrand Prix Europy oraz dodatkowe cztery punkty dały mu dwunaste miejsce na koniec sezonu, został jednak pokonany przez zespołowego partnera,Davida Coultharda. W drugim roku startów wRed Bull Racing był lepszy od Brytyjczyka, który wdawał się w różne kolizje. Red Bull w tym sezonie w klasyfikacji generalnej został wyprzedzony przez siostrzaną ekipęScuderia Toro Rosso. Ostatecznie 21 punktów dało mu jedenastą pozycję w klasyfikacji generalnej. 3 lipca 2008 ogłoszono, iż Mark Webber będzie kierowcą tego zespołu również w sezonie2009 mając za partneraSebastiana Vettela, który zastąpił odchodzącego na sportową emeryturęDavida Coultharda[1]. PodczasGrand Prix Niemiec 2009 zdobył swoje pierwsze Pole Position w Formule 1 i odniósł pierwsze zwycięstwo. Wygrał także przedostatni wyścig sezonu,Grand Prix Brazylii.
W sezonie2010 kontynuował starty wRed Bull Racing zSebastianem Vettelem. Na torzeSepang startował z pole position, ale wyścig ukończył na drugiej pozycji po tym, jak został wyprzedzony przez Vettela na starcie. W Hiszpanii zdobył pole position i wygrał wyścig. Odniósł także zwycięstwo w prestiżowymGrand Prix Monako. Na torzeIstanbul Park wTurcji wywalczył kolejne pole position, i prowadził w wyścigu, Vettel zaczął go doganiać. Spróbował ataku za zakrętem 11. Wcisnął się po wewnętrznej, po czym próbował zejść na zewnętrzną stronę toru. Bolidy zderzyły się, Vettel nie ukończył wyścigu, a Webber po wymianie skrzydła dojechał na trzeciej pozycji obejmując prowadzenie w klasyfikacji generalnej. Na wyścig naSilverstoneRed Bull Racing przygotował dwa nowe skrzydła do swoich bolidów. Podczas treningu mocowanie przedniego skrzydła w bolidzie Vettela uległo uszkodzeniu, i skrzydło zostało zniszczone. Zespół zdecydował zamontować w bolidzie młodego Niemca skrzydło z bolidu Webbera, który dostał starą wersję skrzydła. W kwalifikacjach był drugi, za Vettelem, na starcie wyprzedził Niemca i odniósł zwycięstwo po kontrowersjach związanych z przednim skrzydłem. NaHungaroringu startował z drugiej pozycji, którą utrzymał na starcie, wygrał wyścig.
Pod koniec 2010 roku dzięki dyskwalifikacjiAndy'ego Priaulxa, Mark Webber otrzymał prestiżową nagrodę BRDC Gold Star 2010[2].