Karierę rozpoczął jesienią 1985 w trampkarzachGórnika Knurów, trenował w drużynie Witolda Słabkowskiego[1]. Podczas jednego z sezonów rozegrał w nich 12 spotkań jakolewy obrońca. Wiosną 1989 zadebiutował w drużynie juniorów Górnika, grając w meczu zGKS Tychy[2].
W 1991 trafił do pierwszego zespołu klubu, występującego wIII lidze; w drużynie, grającej pod nową nazwą – Concordia Knurów, zadebiutował 10 kwietnia 1992 w meczu zCarbo Gliwice[2].
W barwach Concordii rozegrał 115 spotkań, ostatni pojedynek zanotował przeciwkoOlimpii Piekary Śląskie w listopadzie 1995[2].
Wiosną 1996 za sprawą treneraBogusława Kaczmarka przeszedł doSokoła Tychy, występującego wekstraklasie[3]. Debiut w ekstraklasie zaliczył 16 marca 1996 w przegranym 2:0 meczu wyjazdowym zLegią Warszawa[2]. Po rozegraniu 15 meczów ligowych odszedł z klubu.
W maju 1998 podpisał nowy kontrakt, obowiązujący do 2003[5]. Wsezonie 1998/1999 na cztery kolejki przed końcem rozgrywekFeyenoord zapewnił sobiemistrzostwo Holandii, a Dudek został uznany przez związek piłkarzy profesjonalnych VVCS za najlepszego bramkarza ligi[5].
Wsezonie 1999/2000Feyenoord zakończył rozgrywki ligowe na trzecim miejscu oraz zdobyłSuperpuchar Holandii, pokonując w finaleAjax Amsterdam 3:2[5]. W tymże sezonie Dudek został ponownie wybrany najlepszym bramkarzem ligi, a także uznano go najlepszym zawodnikiem w plebiscycie gazet „De Telegraaf”[5]. Został też okrzyknięty najlepszym polskim piłkarzem sezonu w plebiscycie tygodnika „Piłka Nożna” oraz otrzymał Piłkarskiego Oscara odPZPN dla najlepszego polskiego zawodnika[5].
Kontrakt Dudka zLiverpool został podpisany wWarszawie i obowiązywał przez pięć lat[6]. WPremier League zadebiutował 8 września 2001 w przegranym 1:3 meczu przeciwkoAston Villi[5]. Wpierwszym sezonie w klubie rozegrał łącznie 35 ligowych spotkań i pomógł zdobyćwicemistrzostwo Anglii. W 2002 otrzymał nominacjęUEFA do nagrody dla najlepszego bramkarza Europy w sezonie 2001/2002[5], jednak zwycięzcą okazał się NiemiecOliver Kahn. Ponadto po raz drugi zdobył Piłkarskiego Oscara dla najlepszego polskiego zawodnika[5].
Na początkusezonu 2004/2005 zdobył zaufanie nowego trenera drużyny,Rafaela Beníteza, który wystawiał Polaka w najważniejszych spotkaniach. W 2005 ponownie zagrał w finalePucharu Ligi Angielskiej, jednak tym razem jego zespół uległ podogrywceChelsea 3:2[5]. 25 maja 2005 zagrał naAtatürk Olimpiyat Stadyumu wStambule w finałowym meczuLigi Mistrzów przeciwkowłoskiemuA.C. Milan, w którym dzięki trzykrotnej obronie w serii rzutów karnych, przyczynił się do zdobycia przez swój klub trofeum[5]. Interwencję Dudka podczas dogrywki uznano za trzecią najefektowniejszą paradę bramkarską w historii piłki nożnej[5] oraz za najbardziej pamiętny moment w historii Ligi Mistrzów[7]. Ponadto drugi raz został nominowany przezUEFA do nagrody dla najlepszego bramkarza[5], jednak tym razem tryumfatorem okazał się CzechPetr Čech. Zdobył takżeSuperpuchar Europy, jednak z powodu urazu nie zagrał przeciwkorosyjskiemuCSKA Moskwa (3:1)[5].
W grudniu 2010 podczas meczu Ligi Mistrzów zAuxerre uległ kontuzji (pęknięcie szczęki), a po operacji udał się na kilkutygodniową rekonwalescencję[12]; w tym czasie jego miejsce w drużynie zajmowałAntonio Adán[13]. W 2011 po zwycięstwieKrólewskich zFC Barceloną (1:0) wWalencji sięgnął poPuchar Króla[14]. Posezonie 2010/2011 odszedł z Realu Madryt, ostatnie spotkanie wKrólewskich rozegrał 21 maja 2011 przeciwkoUD Almeríi[5]. Żegnany oklaskami przez kibiców i przechodzący w szpalerze utworzonym przez kolegów z drużyny, zszedł z boiska w 78. minucie meczu[15]. Przed rozpoczęciem meczu pożegnalnego dostał od dyrektora sportowego klubuJorgego Valdano i prezesaFlorentina Péreza statuetkę z wygrawerowanym napisem: „Jerzy Dudek: Real Madrid 2007–2011”, a także koszulkę z podpisami zawodników i trenerów.
Wkrótce po odejściu z Realu Madryt zakończył piłkarską karierę.
Wspólnie z Dariuszem Kurowskim wydał dwie książki biograficzne:Uwierzyć w siebie. Do przerwy 0:3 w 2005 iNieREALna kariera w 2015. Ponadto w 2012 we współpracy z psychologiem sportowym Pawłem Habratem wydał książkęPod presją. Jak wytrzymałość psychiczna pomaga zwyciężać[7]. Był także bohaterem książki Piotra SkorupyJerzy Dudek. Wybitny z Knurowa, wydanej w 2013[7].
W sierpniu 2005 zadebiutował w roli telewizyjnego komentatora piłki nożnej, relacjonując widzomTVP mecz Liverpool – CSKA Moskwa[5]. Po zakończeniu kariery sportowej został ekspertem i komentatorem telewizyjnym piłki nożnej. Jest ekspertem, głównieTVP Sport. Występował też w kanałach sportowychPolsatu oraz komentował kilka meczów wEurosporcie.
W 2011 został ambasadorem kampanii reklamowej „Teraz golf”, organizowanego przezPolski Związek Golfa programu promującego tę dyscyplinę[7]. W 2011 nawiązał współpracę z firmąCastrol jako ambasador projektów promujących piłkę nożną[22], promował medialnie m.in.Mistrzostwa Europy w Piłce Nożnej 2012, których firma była oficjalnym sponsorem[23].
Urodził się wRybniku, jest synem Renaty i Andrzeja Dudków[2]. Dzieciństwo i młodość spędził wSzczygłowicach[34], jednej z dzielnicKnurowa[35]. Ma dwóch młodszych braci,Dariusza (ur. 1975) i Piotra (ur. 1984). Wychowywał się w rodzinie górniczej, uczył się w Technikum Górniczym.
15 czerwca 1996 ożenił się z Mirellą Litwin[2], z którą ma syna Aleksandra (ur. 1996) oraz córki: Wiktorię (ur. 2006) i Natalię (ur. 2006)[36]. Mieszka wKrakowie[37].
Amatorsko gra wgolfa[38]. Startował w kilku wyścigach samochodowych jako licencjonowany kierowca wyścigowy[39].
W 2005 założył Fundację „Dobry Start – sport przyszłością”, zajmującą się budową boisk piłkarskich dla dzieci mieszkających na wsiach i małych miastach[5]. W styczniu 2013 otworzył Akademię Sportu Progres Jerzego Dudka, działającą przy Centrum Rozwoju Com-Com Zone Nowa Huta w Krakowie[22].