Dnia 14 kwietnia 1965 zostały połączone dwa kluby: SC Enschede oraz Enschedesche Boys, wskutek czego powstał nowy klub – FC Twente. Największym sukcesem w historii klubu był finałPucharu UEFA w 1975, gdy Twente przegrało w meczu (1:5) zniemieckim klubemBorussia Mönchengladbach. W 1925 klub zEnschede, SC Enschede, zdobył mistrzostwoHolandii, zaś w 1974 FC Twente było wicemistrzem Holandii. WPucharze Holandii klub triumfował 2 razy, w 1977 i 2001, zaś w 2004 przegrał w finale tych rozgrywek zUtrechtem. W 2004 zawodnikiem klubu był przez krótki czaspolski junior Michał Protasewicz, natomiast od 2008 gra w nim bramkarzFilip Bednarek (w latach 2008–2012 w sekcji juniorów). W sezonie 2008/2009 klub FC Twente zdobył wicemistrzostwo, a w sezonie 2009/2010 mistrzostwo Holandii. W sezonie 2010/2011 klub ponownie zdobył wicemistrzostwo Holandii. W 2018 klub zajął ostatnie 18. miejsce w Eredivisie i spadł do drugiej ligi.