Miasto powstało najprawdopodobniej około 800 roku. Najstarszą wzmianką o jego znaczeniu jako siedziby handlu morskiego jest adnotacja z roku 1224 zLondynu o „statku handlowym z Emden”. Od 1464 było stolicąHrabstwa Fryzji Wschodniej. Rewolucja znana dziś jako „Emder Revolution” z roku 1595 doprowadziła do wygnania hrabiegoWschodniej Fryzji z miasta. Wybrany w 1604 roku syndyk miastaJohannes Althusius poprowadził je ku bogactwu. W 1744 Wschodnią Fryzję wraz z miastem anektowałoKrólestwo Prus.
W Emden znajduje się zakład produkcyjnyVolkswagena, w którym produkuje sięVW Passata. Ponadto w mieście rozwinął się przemysł stoczniowy, maszynowy, rybny oraz rafineryjny[2].
W roku 1543Jan Łaski otrzymał odregentkiFryzji wschodniej Anny oldenburskiej nominację na stanowiskoefora wszystkich kościołów tego państwa iproboszcza parafii w Emden. Łaski stał się duchownym ewangelickim i pionierem Reformacji we Fryzji, umiejętnie prowadząc działalność misyjną między naciskami ze strony katolików ianabaptystów. Łaski napisał swój manifest teologicznyEpitome oraz opracował katechizm. Odniósł sukces, eliminując katolicyzm z terenu księstwa. Wyjechał w 1550 r. do Anglii.
