od 2023-02 →zweryfikować treść idodać przypisy, od 2023-02 → zaktualizować na podstawie najświeższych informacji. Dokładniejsze informacje o tym, co należy poprawić, być może znajdują się wdyskusji tego artykułu. Po wyeliminowaniu niedoskonałości należy usunąć szablon{{Dopracować}} z tego artykułu.
Bruno Alves zawodową karierę rozpoczął wFC Porto. W 1999 zadebiutował w jego rezerwach, dla których rozegrał łącznie 55 spotkań i strzelił 8 goli. Następnie był wypożyczany do innych drużyn: kolejno doSC Farense,Vitórii SC orazAEK Ateny.
W 2005 Bruno Alves powrócił do swojego pierwszego klubu w karierze –FC Porto i zdobył z nimmistrzostwo Portugalii. W sezonie2005/2006 wystąpił jednak tylko w 7 ligowych pojedynkach. Kluczowym momentem w karierze Bruno Alvesa było przybycie naEstádio do DragãoJesualdo Ferreiry. Wówczas Alves wywalczył sobie miejsce w pierwszym składzie i razem ze swoim rodakiemPepe stworzył duet środkowych obrońców. Porto w sezonie2006/2007 sięgnęło pomistrzostwo kraju, a to samo osiągnięcie powtórzyło wkolejnych rozgrywkach.
W czerwcu 2007 Portugalczyk był łączony z przenosinami najpierw doAston Villi, a później doLiverpoolu. Oba te transfery ostatecznie nie doszły do skutku. W sezonie2008/2009 Bruno Alves razem ze swoim klubem zdobył wszystkie krajowe trofea –mistrzostwo,Puchar orazSuperpuchar Portugalii. W rozgrywkachPrimeira Liga zanotował 30 występów i strzelił 5 bramek. Zdobył między innymi zwycięskiego gola w wygranym 2:1 spotkaniu z lizbońskimSportingiem. Za sezon 2008/2009 Alves został nagrodzony nagrodą dla najlepszego zawodnika ligowych rozgrywek.
1 lipca 2013 roku został sprzedany z 5,5 mln euro do tureckiegoFenerbahçe SK.
Alves powrócił do najwyższej włoskiej ligi latem 2018 roku, dołączając do niedawno awansowanejParmy do końca czerwca 2019, jednak w lutym 2019 przedłużył kontrakt o rok. Grał we włoskim klubie aż do jego spadku doSerie B. 30 maja 2021 roku ogłosił opuszczenie klubu.
Pod koniec kariery Alves zgodził się na dwuletni kontrakt wFC Famalicão, jednak po kłótni z dyrekcją klubu, odwołał ją. 4 września 2021 roku Portugalczyk podpisał roczną umowę z greckim klubemApollon Smyrnis w wieku prawie 40 lat. Tym sposobem wrócił po raz pierwszy od 16 lat donajwyższej greckiej ligi. Ogłosił przejście na sportową emeryturę w czerwcu 2022, jednak wkrótce został mianowany dyrektorem sportowymAEK Ateny.