Bakari Koné rozpoczynał swoją karierę w największym klubie swojego kraju,ASEC Mimosas. Później krótko grał w lidzekatarskiej, jednak prawdziwą gwiazdą stał się po przyjeździe doFrancji i doskonałej grze wLigue 2 w barwachFC Lorient. W sezonie2004/2005 zdobył 24 gole i został najlepszym graczem sezonu wLigue 2, po zakończeniu sezonu przeniósł się do grającego w wyższej klasieOGC Nice, z którym dotarł w2006 do finałuPucharu Ligi Francuskiej. W 95 występach w barwach OGC, zdobył 29 bramek, po czym odszedł doOlympique Marsylia.