Fort Jesus er en befestning fra 1593 i som ligger på øyaMombasa utenfor havnebyenMombasa iKenya. Fortet ble bygget avportugisiske sjøfarere. Anlegget ble i 2011 oppført på UNESCOsverdensarvliste, og det regnes som en av de best bevarte eksemplene på portugisisk 1500-talls festningsbyggverk.
Anlegget ble bygget avGiovanni Battista Cairati fra Milano mellom 1593 og 1596; han var ansvarlig arkitekt for Portugals interesser i østen. Fortet fikk raskt avgjørende betydning for evnen til å kontrollere innseilingen til Mombasa og havna der. Mellom 1631 og 1875 var det ni skifter mellom ulike nasjoner om å ha kontroll over fortet. Både arabiske sjøfarere fraOman ogBritisk Øst-Afrika har hatt kommando der. I britenes tid var fortet brukt som fengsel. Anlegget ble fredet i 1958 og er i dag et museum.
Festningsmurene. Fortet har et menneskelignende omriss, sett fra luften.