Het gebied is ontstaan in 1871 als gevolg van hetVerdrag van Frankfurt, dat deFrans-Duitse Oorlog beëindigde. Terwijl Duitsland volgens dit verdrag het grootste deel van de Elzas en een belangrijk deel vanLotharingen annexeerde, werd het uiterste zuidwesten van het departement Haut-Rhin rond de stad Belfort aan Frankrijk toegewezen. Er waren twee belangrijke redenen hiervoor:
de bevolking rond Belfort was bijna geheel Franstalig, in tegenstelling tot de bevolking van de door hetDuitse Keizerrijk geannexeerde gebieden;
de stad Belfort had een heroïsche tegenstand geboden onder het bevel van kolonelAristide Denfert-Rochereau ten tijde van het beleg door de Duitse troepen en het zou voor de Fransen ondenkbaar zijn dat deze stad na de oorlog deel van Duitsland zou worden.
Na de annexatie vanElzas-Lotharingen door Frankrijk als gevolg van hetVrede van Versailles na deEerste Wereldoorlog werd het departement Haut-Rhin hesteld maar zonder het Territoire de Belfort dat zijn speciaal statuut behield tot in1922 het Territoire de Belfort officieel het 90e Franse departement werd.