Hij deed mee aan de verkiezingen in2000 en won in de tweede ronde, waardoor hij de opvolger werd vanJerry Rawlings, die hem eerder verslagen had bij de verkiezingen voor het presidentschap in 1996. Kufuors overwinning markeerde de eerste vreedzame democratische machtsoverdracht in Ghana sinds de onafhankelijkheid van het land werd uitgeroepen. Bij de verkiezingen op7 december2004 werd Kufuor in de eerste ronde herkozen met 52,45% van de stemmen. Zijn partij, de New Patriotic Party, vergrootte het aantal zetels in het parlement van Ghana.
Onder het bewind van Kufuor kent Ghana stabiliteit en een sterkeeconomische groei. Het inkomen per hoofd van de bevolking is, mede dankzij de bodemrijkdommen, twee keer zo hoog als in omringende Afrikaanse landen. Het land onderhoudt met vele landen handelsbetrekkingen, waaronderNederland. Tijdens Kufuors regeerperiode zijn het belastingstelsel en het monetaire stelsel herzien. Met het laatste werd mede beoogd de hoge inflatie een halt toe te roepen.
Kufuor was ook voorzitter van deAfrikaanse Unie, van 2007 tot 2008.
President Kufuor bracht van 21 tot 23 oktober 2008 een staatsbezoek aan Nederland. Hij hield daarbij, in aanwezigheid van de in Den Haag residerende ambassadeurs van Afrikaanse landen, in de vergaderzaal van deEerste Kamer ook een toespraak voor leden van de Eerste enTweede Kamer derStaten-Generaal. In september 2009 bezocht Kufuor Nederland opnieuw. Hij bezocht toen onder meer de manifestatie Ontwikkelingssamenwerking.nu inDen Haag en hield een lezing op hetAfrika Studiecentrum in Leiden.
Kufuor behoort tot de etnische groep van deAshanti. Hij is getrouwd met Theresa Kufuor (geboren Mensah), met wie hij vijf kinderen heeft. Kufuor en zijn familie zijn rooms-katholiek. Hij werd geboren in Kumasi en opgeleid aan de Osei Tutu Boarding School (1951-53), het Prempeh College (1954-58), Lincoln's Inn,Londen (1959-1961) en het Exeter College van deUniversiteit van Oxford (1961-1964). Kufuor is, met zijn rijzige gestalte, een sportieve man. Zijn hobby's zijn tafeltennis, lezen, voetbal en films kijken.
Zijn voornaamKofi verwijst naar de dag van zijn geboorte: vrijdag.