Eengeconjugeerd systeem is een systeem van atomen in eenorganische verbinding met afwisselendenkele bindingen endubbele bindingen. Deπ-elektronen van geconjugeerde dubbele bindingen zijngedelokaliseerd. Ze behoren niet meer tot één binding, maar worden gedeeld over alle naburige bindingen in het geconjugeerde systeem. De reden is dat een geschikteorbitaaloverlap kan ontstaan tussen dep-orbitalen. Een eigenschap van geconjugeerde systemen is dat zij vaak op een gerichte manier metelektromagnetische straling kunnen interageren. Veel geconjugeerde verbindingen bezitten dan ook een specifiekekleur.
In dekwantummechanica wordt een completere beschrijving van het gedrag vanelektronen gegeven. Debenadering van Hückel is een methode waarbij eenmolecuulorbitaal-diagram kan worden opgesteld van geconjugeerde systemen en waaruit eveneens debindingsorde van de bindingen in het systeem kan worden berekend. Hieruit blijkt inderdaad dat de schijnbaar enkelvoudige bindingen eveneens een dubbelbindingskarakter bezitten.
Een bekend voorbeeld is debenzeenring in bijvoorbeeldbenzeen offenol, waarbij de geconjugeerde dubbele bindingen een ring vormen. Omdat de eigenschappen van de binding niet meer beschreven kunnen worden op de manier vanenkele endubbele bindingen, worden de π-elektronen in benzeen vaak niet als tweede binding getekend tussen drie paren koolstofatomen, maar als een cirkel die in één keer alle koolstofatomen bestrijkt. Allearomatische verbindingen bezitten per definitie een geconjugeerd systeem.
Ook (complexen van)biomoleculen met geconjugeerde systemen komen voor, waaronderbètacaroteen,ftalocyanines,bladgroen,porfyrinen enfagopyrine.
