HetCO1-gen,MT-CO1-gen ofcytochroomc oxidase subunit 1-gen is een stofwisselingsgen dat voorkomt op hetmitochondriaal DNA van alle levende wezens. Het gen heeft een lengte van 648basenparen.

Het gen codeert voor de subunit 1 vancytochroom c oxidase (COX1), eenenzym dat een cruciale rol speelt in de energiehuishouding van het organisme, met name in deoxidatieve fosforylering.

Mitochondriaal DNA heeft een hoge mutatiesnelheid, waardoor denucleotidesequentie (de juiste volgorde van de verschillende basenparen) tussen verschillende soorten sterk varieert. Daarenboven heeft het CO1-gen eigenschappen die het bij uitstek geschikt maken voorDNA-barcoding, althans bijdieren:

• het gen is kort genoeg om de nucleotidesequentie met de huidige technologie snel te kunnen bepalen;
• het gen is lang genoeg om voldoende variatie in de nucleotidesequentie te vertonen over alle soorten heen, zodat twee verschillende soorten duidelijk kunnen onderscheiden worden; zo verschillen twee nauw verwante soorten als demens en dechimpansee op ongeveer 60 plaatsen;
• daarentegen vertoont het binnen één soort een zeer beperkte variatie; zo verschillen bij de mens maximaal twee van de 648 basenparen;

Bijplanten is het CO1-gen minder geschikt voor DNA-barcoding door de veel lagere mutatiesnelheid, en moeten andere genen gezocht worden.

• Gen