In1503 gaf Julius II Bramante de leiding over een veel groter project: de bouw van de nieuweSint-Pietersbasiliek. Hij ontwierp een kerk met de grondvorm van eenGrieks kruis, een symbool dat in die tijd werd gezien als perfectie. Zijn plannen werden echter omgegooid na zijn dood, hoewelMichelangelo ze grotendeels in ere herstelde. Door de planning van de Sint-Pieter had Bramante weinig tijd of aandacht voor andere opdrachten. Toen hij in 1514 stierf was de bouw van de kerk nog maar amper begonnen.
