| Pirmoji komanda | Antroji komanda | I rungt. | II rungt. |
 Solnos AIK (Švedija) |  Valensijos CF (Ispanija) | 0-1 | 0-1 |
 Bukarešto „Dinamo“ (Rumunija) |  Donecko „Šahtar“ (Ukraina) | 2-0 | 3-2 |
 Haifos „Maccabi“ (Izraelis) |  Celės „Publikum“ (Slovėnija) | 2-1 | 2-2 |
 Sofijos CSKA (Bulgarija) |  Maskvos „Torpedo“ (Rusija) | 1-1 | 1-1[2] |
 Dandi FC (Škotija) |  Perudžos „Calcio“ (Italija) | 1-2 | 0-1 |
 Skopjės „Cementarnica“ (Makedonija) |  Lanso RC (Prancūzija) | 0-1 | 0-5 |
 Niukaslo prie Taino „United“ (Anglija) |  Bredos NAC (Nyderlandai) | 5-0 | 1-0 |
 La Luvjero RAA (Belgija) |  Lisabonos „Benfica“ (Portugalija) | 1-1 | 0-1 |
 Atėnų „Paniṓnios“ (Graikija) |  Farumo „Nordsjælland“ (Danija) | 2-1 | 1-0 |
| Edinburgo „Heart of Midlothian“ (Škotija) |  Sarajevo „Željezničar“ (Bosnija ir Hercegovina) | 2-0 | 0-0 |
 Zalcburgo „Wüstenrot“ (Austrija) | Udinės „Calcio“ (Italija) | 0-1 | 2-1 |
 Ankaros „Gençlerbirliği“ (Turkija) | Blakberno „Rovers“ (Anglija) | 3-1 | 1-1 |
 Pūchovo „Matador“ (Slovakija) | Barselonos FC (Ispanija) | 1-1 | 0-8 |
 Zagrebo „Dinamo“ (Kroatija) |  Budapešto MTK (Vengrija) | 3-1 | 0-0 |
| Ramat Gano „Hapoel“ (Izraelis) | Sofijos „Levski“ (Bulgarija) | 0-1 | 0-4 |
 Kaizerslauterno FC (Vokietija) |  Teplicės FK (Čekija) | 1-2 | 0-1 |
 Smederevo SARTID (Serbija ir Juodkalnija) | Prahos „Slavia“ (Čekija) | 1-2 | 1-2 |
| Viljarealio CF (Ispanija) | Trabzono „Trabzonspor“ (Turkija) | 0-0 | 3-2 |
 Ciuricho „Grasshopper“ (Šveicarija) | Splito „Hajduk“ (Kroatija) | 1-1 | 0-0 |
| Berlyno „Hertha“ (Vokietija) |  Didžiosios Lenkijos Grodzisko „Dyskobolia“ (Lenkija) | 0-0 | 0-1 |
| Liublianos „Olimpija“ (Slovėnija) | Liverpulio FC (Anglija) | 1-1 | 0-3 |
 Oslo „Vålerenga“ (Norvegija) | Graco AK (Austrija) | 0-0 | 1-1 |
 Kišiniovo „Zimbru“ (Moldavija) | Salonikų „Árīs“ (Graikija) | 1-1 | 1-2 |
| Budapešto „Ferencváros“ (Vengrija) | Kopenhagos FC (Danija) | 1-1 | 1-1[3] |
| Varaždino „Varteks“ (Kroatija) | Debreceno VSC (Vengrija) | 1-3 | 2-3 |
| Hamburgo SV (Vokietija) | Dniepropetrovsko „Dnìpro“ (Ukraina) | 2-1 | 0-3 |
| Bordo „Girondins“ (Prancūzija) | Bratislavos „Artmedia“ (Slovakija) | 2-1 | 1-1 |
| Romos AS (Italija) | Skopjės „Vardar“ (Makedonija) | 4-0 | 1-1 |
| Mančesterio „City“ (Anglija) | Lokereno „Sporting“ (Belgija) | 3-2 | 1-0 |
| Maskvos „Spartak“ (Rusija) | Esbjergo fB (Danija) | 2-0 | 1-1 |
| Krokuvos „Wisła“ (Lenkija) | Neimegeno NEC (Nyderlandai) | 2-1 | 2-1 |
| Leirijos „União“ (Portugalija) | Moldės FK (Norvegija) | 1-0 | 1-3 |
| Vienos „Austria“ (Austrija) | Dortmundo „Borussia“ (Vokietija) | 1-2 | 0-1 |
| Osero AJ (Prancūzija) | Nešatelio „Xamax“ (Šveicarija) | 1-0 | 1-0 |
 Ventspilio FK (Latvija) | Trondheimo „Rosenborg“ (Norvegija) | 1-4 | 0-6 |
| Gaziantepo „Gaziantepspor“ (Turkija) | Tel Avivo „Hapoel“ (Izraelis) | 1-0 | 0-0 |
| Odensės BK (Danija) | Belgrado „Crvena Zvezda“ (Serbija ir Juodkalnija) | 2-2 | 3-4 |
| Lisabonos „Sporting“ (Portugalija) | Malmės FF (Švedija) | 2-0 | 1-0 |
| Utrechto FC (Nyderlandai) | Žilinos MŠK (Slovakija) | 2-0 | 4-0 |
| Donecko „Metalurg“ (Ukraina) | Parmos FC (Italija) | 1-1 | 0-3 |
 Anjalankoskio „MyPa“ (Suomija) | Sošo FC (Prancūzija) | 0-1 | 0-2 |
| Velikos „Kamen Ingrad“ (Kroatija) | Gelzenkircheno „Schalke“ (Vokietija) | 0-0 | 0-1 |
 Nikosijos APÓEL (Kipras) | Maljorkos Palmos „Mallorca“ (Ispanija) | 1-2 | 2-4 |
| Sautamptono FC (Anglija) | Bukarešto „Steaua“ (Rumunija) | 1-1 | 0-1 |
| Roterdamo „Feyenoord“ (Nyderlandai) | Klagenfurto „Kärnten“ (Austrija) | 2-1 | 1-0 |
| Salonikų PAÓK (Graikija) | Oslo „Lyn“ (Norvegija) | 0-1 | 3-0 |
| Malatijos „Malatyaspor“ (Turkija) | Bazelio FC (Šveicarija) | 0-2 | 2-1[1] |
| Kopenhagos „Brøndby“ (Danija) | Prahos „Viktoria Žižkov“ (Čekija) | 1-0 | 1-0 |
