DĖMESIO:toliau atskleidžiamos kūrinio detalės
Veiksmas prasideda pingvinams nusprendus pabėgti iš zoologijos sodo į laukinę gamtą. Kai jie išsikasa tunelį, atsiduria zebro Marčio aptvare. Jie netyčia pasako apie savo planus zebrui. Šis taip pat nutaria sprukti į laukinę gamtą. Martis pabėga iš zoologijos sodo. Jo draugailiūtas Aleksas,begemotė Glorija iržirafa Melmanas išsiruošia jį sustabdyti. Tačiau Niujorko geležinkelio stotyje juos sulaiko už gyvūnų priežiūrą atsakingi darbuotojai ir nusprendžia juos išsiųsti į laukinę gamtą. Gyvūnai uždaromi į dėžes ir sukraunami į laivą. Tačiau pingvinams pavyksta užgrobti laivą. Dėžės su liūtu, zebru, žirafa ir begemote iškrenta į jūrą. Jūros bangos dėžes išmeta įMadagaskarą, kur draugai susitinka. Jie nusprendžia, kad tenSan Diegas, o vėliau nusprendžia apžiūrėti vietovę. Džiunglių gilumoje veikėjai susitinka sulemūrais, kurie iš pradžių jų išsigąsta. Tačiau kai lemūrus užpuola fosos (vilkai), liūtas juos nubaido ir lemūrai bando su jais susidraugauti. Bet Aleksas, jau pamiršęs mėgstamo kumpio skonį, bando atsikąsti Marčio. Liūtas supranta, kad tapo pabaisa ir stengiasi atsiskirti nuo kitų. Tačiau pavojaus akimirką jis išgelbėja zebrą nuo fosų. Zebras ir liūtas vėl tampa draugais. Filmo pabaigoje jiems su žirafa ir begemote atsiranda galimybė grįžti laivu į Niujorką.