I 1646 stiftede Pascal bekendtskab medjansenismen med dens krav om, at det kristne menneske på det åndelige plan bør frigøre sig fra denne verdens goder og leve et fromt liv i streng overensstemmelse med Bibelens bud. Dette krav søgte han i stigende grad at efterleve.

Natten til den 24. november 1654 oplevede han en religiøs vækkelse, som fik ham til yderligere at nærme sig denne asketiske retning. I 1656 blev han opfordret til at forsvare jansenismen imodjesuitternes angreb, hvilket han gjorde i en rækkeLettres écrites à un provincial (1657, Breve til en provinsbo, ellerProvincialbreve; dansk udgave 1876), hvori han på bidende ironisk måde kritiserede den jesuitiske moralteologi (kasuistik). Disse breve er en af den franske prosas klassikere.

De sidste år af sit liv arbejdede Blaise Pascal, som da var præget af sygdom og tiltagende svaghed, på et forsvarsskrift for kristendommen. Han nåede ikke at fuldende det, men de mange noter og optegnelser til det blev efter hans død udgivet under titlenPensées (1670, på danskTanker, 1866; seneste danske udgave 1986). Heri beskrives mennesket som et misforhold, et intet i forhold til Gud og et univers i forhold til intetheden; eller, som det hedder i en berømt optegnelse, "mennesket er et siv, men et tænkende siv".

Blaise Pascals forsvar for kristendommen byggede på denne menneskeopfattelse, idet han mente, at det kun for kristendommen var muligt at forklare menneskets splittede natur. Som skabt af Gud er det hans ligemand; som syndigt har det mistet sin storhed og er lig dyret.

Kun gennem troen kan mennesket fatte sig selv.Le cœur a ses raisons, que la raison ne connaît pas 'Hjertet har sine grunde, som fornuften ikke kender', som det hedder i et andet berømt fragment.

Med sin beskrivelse af menneskets situation, dets splittede natur og dets ensomhed i videnskabens uendelige rum og med sin afvisning af fornuftens evne til at opnå selverkendelse formulerede Blaise Pascal temaer, som genfindes i dele af 1900-tallets livsfilosofi, fx ieksistentialismen.

• Pascals trekant
• jansenisme