몬테네그로는 국민 투표에서 독립이 결정된 이후 2006년 6월 3일 세르비아로부터 독립을 선언했다. 세르비아의 일부로서 몬테네그로는 비공식적으로 .cg.yu 2차 도메인을 사용하고 있었으나, 몬테네그로는 .mn.yu 도메인을 사용했으며.cs 최상위 도메인은 유고슬라비아가 해체된 이후 2003년 몬테네그로에 할당되었지만 사용되지 않았다. 이후 몬테네그로는 국제 표준화기구 (International Organization for Standardization)에서 할당한 ISO 3166-1 두 글자 코드에서 "ME"를 할당받았다.
2007년 9월 ICANN은 .me 도메인의 운영 권한을 몬테네그로 정부에 위임했다. 이전 .yu 도메인은 .rs 도메인 레지스트리 (Serbian National Register of Internet Domain Names)에 의해 일시적으로 운영되었지만, 2009년 9월 30일 사용이 중단되었다. 루트 네임서버의 위임은IANA에 의해 승인되었다.
이후 2008년 7월 16일에 모든 .me 도메인에 대해 다양한 등록 기관의 모든 사람이 등록할 수 있게 되었다.
