꽃자루(peduncle)는식물학에서꽃차례나 단 하나의꽃을 지탱하는 줄기이거나,수정 후에는 화순이나 단 하나의열매를 지지하는 줄기이다. 꽃자루에는 때때로 마디에 포(엽초의 일종)가 있다. 꽃자루 위의 꽃차례의 주축은꽃대(rachis)이다. 꽃자루에는 꽃이 없지만 줄기에 꽃이 핀다.[1][2][3]
꽃자루가 압축된 공중 줄기 또는 지하 줄기(땅속줄기,알뿌리,비늘줄기,알줄기)에서 지상에서 발생하고, 줄기나 꽃턱 근처 부분을 제외하고는 포가 거의 또는 전혀 없는 경우를 꽃자루라고 한다.