奥尻郡（おくしりぐん）は、北海道（後志国）檜山振興局の郡。人口2,101人、面積142.99km²、人口密度14.7人/km²。（2025年9月30日、住民基本台帳人口）
以下の1町を含む。
1879年（明治12年）に行政区画として発足して以来、郡域は上記1町のまま変更されていない。
日本書紀に記された、斉明天皇6年3月に阿倍比羅夫が粛慎の砦を陥落させた弊賂弁嶋は、現在の奥尻島にあたるといわれている（粛慎の本拠地、樺太とする説もある）。
室町時代には、享徳3年8月28日に松前藩祖・武田信広公が漂着。文明元年6月5日、若狭国の僧随芳が草庵を建立。これは延徳2年大館（渡島国津軽郡松前）に移り松前山法源寺となった。弘治元年7月、上杉謙信の臣宇田遠江守師長が従者3名と漂着。
江戸時代、奥尻郡域は和人地となる。松前藩によってヲコシリ場所が開かれ、元和3年5月、松前山法源寺第4世芳龍が、現在の青苗地区に空谷山大仙寺を建立。寛文7年空谷山大仙寺が松前城下蔵町に移転。安永年間には薬師村（現在の奥尻町字松江）の少彦名神社が創建されている。
江戸時代後期の文化4年には、奥尻郡域は天領とされた。文政4年には松前藩の元に戻されたものの、安政2年再び天領となり津軽藩が警固をおこなった。戊辰戦争（箱館戦争）終結直後の1869年8月15日、大宝律令の国郡里制を踏襲して奥尻郡が置かれた。
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