Varisella è collocata inVal Ceronda. Il comune è limitato dal crinale spartiacque nel tratto compreso tra ilmonte Druina e ilmonte Bernard; versonord il confine è rappresentato dalla Costa Druina, dal rio Rumello e daltorrente Ceronda, mentre la porzione nord-orientale del territorio comunale è chiusa dal rio delle Mosche.È bagnato dal torrente Ceronda e dai suoi affluenti, e comprende le seguenti cime (in senso orario):
Il centro comunale è collocato a 514 m s.l.m. in posizione dominante sulla sinistra orografica del torrente; a monte si trovano le frazioni di Ramai (592 m s.l.m.) e Moncolombone (568 m s.l.m.) mentre più a valle, piuttosto defilato sulla destra del corso d'acqua, sorge il piccolo nucleo diBaratonia (460 m s.l.m.).
A cavallo del crinale che separa Varisella dalla conca diGivoletto si trova laRiserva naturale integrale della Madonna della Neve sul Monte Lera.
