Giocatore veloce e valido in progressione,[1] apprezzato per il dinamismo, le qualità tecniche e la resistenza, agli esordi è stato impiegato comeala, per poi diventare un attaccante centrale. Elogiato per la capacità di ripiegamento e di dialogo con i centrocampisti, è abile nel gioco aereo, nei movimenti senza palla ed è in possesso di un ottimo fiuto del gol. Uno dei suoi punti di forza è il tiro dalla distanza, specialmente con il piede destro.[2]
Prodotto del settore giovanile delloStoccarda, compie la trafila nel vivaio del club e nel 2012-2013 viene promosso nella squadra Under-19 malgrado abbia solo 16 anni. Nel 2013 si aggiudica il premioFritz Walter con 24 gol in campionato.
Il 1º agosto 2013, all'inizio della nuova stagione, diviene il più giovane esordiente nella storia dello Stoccarda, disputando la sua prima partita con la prima squadra, un match diEuropa League, all'età di 17 anni, 4 mesi e 25 giorni.[3] Sedici giorni più tardi debutta anche inBundesliga contro ilBayer Leverkusen. Il 22 settembre segna il suo primo gol da professionista ai danni dell'Eintracht Francoforte. Il 10 novembre, grazie ai due gol contro ilFriburgo, diventa il calciatore più giovane a segnare una doppietta nel campionato tedesco.
In tre anni con la maglia dello Stoccarda realizza 14 reti in 103 partite totali.
L'11 giugno 2016 passa per 10 milioni dieuro ai neopromossi delLipsia, firmando un contratto quadriennale. Il 26 settembre, scendendo in campo nella gara di campionato contro ilColonia, diventa, all'età di 20 anni e 203 giorni, il più giovane calciatore a raggiungere quota 100 presenze in Bundesliga, migliorando di 22 giorni il precedente record diJulian Draxler. Nella prima annata, con 21 reti in 32 partite (miglior realizzatore tedesco del campionato), contribuisce alla storica qualificazione della squadra allaUEFA Champions League.
Nel marzo 2018, contro lo Stoccarda, diviene il più giovane calciatore a ottenere 150 presenze in Bundesliga, battendo il primato diCharly Körbel. Conclude l'annata 2017-2018 con 13 reti, tra cui quella decisiva per battere per 2-1 ilBayern Monaco. Nella stagione seguente ottiene la centesima presenza con il Lipsia, nella partita di campionato contro ilFortuna Düsseldorf, e supera quota 50 reti in Bundesliga. Il 23 novembre 2019 diviene il più giovane calciatore a raccogliere 200 presenze nel massimo campionato tedesco.[4] Dopo la conclusione dellaBundesliga 2019-2020, Werner conclude anche la sua esperienza in Germania, lasciando il Lipsia dopo 4 stagioni e 95 gol segnati.
Il 18 giugno 2020 ilChelsea annuncia di aver trovato un accordo per il suo trasferimento a titolo definitivo a partire dal 1º luglio successivo; il costo del cartellino è stato di 53 milioni di euro.[5][6] Fa il proprio debutto ufficiale con la maglia dei Blues il 14 settembre successivo, in un match contro ilBrighton.[7] Il 29 settembre 2020 mette a segno la sua prima rete con i blues nel corso degli ottavi di finale della Coppa di Lega inglese contro il Tottenham (partita poi persa ai rigori).[8] Il 17 ottobre segna i suoi rimi gol in campionato, contribuendo con una doppietta al pareggio 3-3 contro ilSouthampton.[9] Il 29 maggio 2021 vince laChampions League, primo trofeo della sua carriera con un club.[10] Conclude la sua prima stagione in Inghilterra con 12 reti, di cui solo 6 in campionato.
Inizia la stagione 2021-2022 vincendo laSupercoppa UEFA 2021 ai rigori contro gli spagnoli delVillarreal.[11] Mette a segno la sua prima rete stagionale il 22 settembre 2021, in una gara di Coppa di Lega contro l'Aston Villa.[12] L'8 dicembre successivo segna la sua prima rete in stagionale inChampions League contro loZenit San Pietroburgo; si tratta del gol più veloce mai segnato dal Chelsea in questa competizione.[13] Termina la sua seconda annata ai londinesi con 37 presenze e 11 reti.
Il 9 agosto 2022 viene ufficializzato il suo ritorno a titolo definitivo alRB Lipsia,[14][15] per una cifra riportata di 20 milioni di euro più eventuali bonus.[16] Torna ufficialmente a vestire la maglia del club il successivo 13 agosto, in una gara contro ilColonia. Il 1º ottobre contribuisce con una doppietta al successo 4-0 contro ilBochum, raggiungendo di fatto la quota di 101 reti in tutte le competizioni con il club.[17] Il 15 aprile 2023 marca la sua centesima rete in Bundesliga, negli sviluppi di un match contro l'Augusta.[18] Termina la stagione con 40 presenze e 16 reti.
All'inizio dell'annata 2023-2024 vince laSupercoppa di Germania battendo ilBayern Monaco per 3-0.[19][20] Segna la sua prima rete stagionale il 23 settembre 2023 decidendo l'incontro in trasferta con ilBorussia M'gladbach.[21] Tuttavia, complice un calo di prestazione, perde il posto da titolare a discapito diLoïs Openda.[22]
Il 9 gennaio 2024 passa in prestito semestrale alTottenham, facendo quindi ritorno inInghilterra dopo un anno e mezzo.[23] Esordisce con gli Spurs cinque giorni dopo, servendo un assist aRodrigo Bentancur in un pareggio 2-2 contro ilManchester Utd.[24] Segna coi londinesi per la prima volta nella vittoria contro ilCrystal Palace (3-1).[25][26] Si ripete la gara successiva, segnando la rete del definitivo 4-0 ai danni dell'Aston Villa.[27][28] Termina il suo primo semestre con 14 presenze e 2 reti.
Il 28 maggio 2024 viene ufficializzato il prolungamento del prestito fino al 30 giugno 2025.[29][30] Werner inizia la stagione 2024-2025 segnando una rete contro ilManchester City in una gara valida per gli ottavi di finale diCoppa di Lega.[31] Il 26 settembre esordisce inEuropa League, rilevandoSon Heung-min al 71' minuto di una gara contro ilQarabağ.[32]
Il 22 marzo 2017 esordisce con lanazionale maggiore in un'amichevole vinta per 1-0 contro l'Inghilterra. Il 25 giugno successivo realizza le sue prime reti, marcando una doppietta decisiva nella partita vinta per 3-1 contro ilCamerun e valida per la fase a gironi dellaFIFA Confederations Cup 2017.[33] Segna anche nella vittoria per 4-1 contro ilMessico in semifinale,[34] che consente alla Germania di qualificarsi per la vittoriosa finale contro ilCile (1-0). Alla fine della competizione Werner si laurea capocannoniere, alla pari con i compagniLeon Goretzka eLars Stindl. Nel 2018 viene convocato per ilcampionato del mondo inRussia, dove la nazionale tedesca esce già dopo la fase a gironi, con Werner che rende al di sotto delle aspettative.[35]
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