Nel1997 si colloca la prima importante esperienza a livello internazionale con la direzione in occasione dellaConfederations Cup inArabia Saudita.
Ha diretto una partita durante ilcampionato del mondo 2002,Svezia-Nigeria aKōbe: la convocazione a questa rassegna iridata arriva inaspettata, in quanto l'arbitro titolare doveva essere l'uruguaianoJorge Larrionda che, però, colpito in patria da una sospensione disciplinare, deve rinunciare al torneo e far posto alla prime delle riserve.
Ha totalizzato anche varie partite di Copa América, nei tornei del1997,2001,2004 e2007, e una semifinale diCopa Libertadores nel2009, suo ultimo anno di attività da internazionale.
Nel 2004 il suo nome viene inserito nella lista dei 46 pre-candidati in vista deiMondiali di calcio 2006 in Germania, ma al termine della selezione Ortubé viene scartato dall'elenco dei 21 arbitri prescelti.
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