IlBrasile è escluso dalle qualificazioni, in quanto vincitore delcampionato del mondo 1962 e qualificato automaticamente alcampionato del mondo 1966. Rimangono quindi 9 squadre: esse vengono divise in tre gruppi, le cui prime classificate accedevano alla fase finale del Mondiale. Il primo gruppo è composto da Uruguay, Perù e Venezuela: la Nazionale uruguaiana vince tutte e 4 le partite, chiudendo il girone a punteggio pieno; il Perù si classifica secondo mentre il Venezuela, alla sua prima partecipazione alle eliminatorie, termina ultimo con 4 sconfitte e una differenza reti di -11. Il secondo gruppo vede primeggiare Cile ed Ecuador, che terminano a pari punti (5). Si rende pertanto necessario uno spareggio, vinto dal Cile per 2-1. L'ultimo gruppo, che include Argentina, Paraguay e Bolivia, viene vinto dalla Nazionale bianco-celeste, che supera il Paraguay 7 punti contro 3. A qualificarsi perInghilterra 1966 sono pertanto Argentina, Cile e Uruguay.