La valle fu menzionata per la prima volta nel 1091, quando fu concessa dal conte diGinevra all'Abbazia benedettina dellaSacra di San Michele, vicino a Torino, che all'inizio del XIII secolo vi aveva stabilito un priorato[3]. Nel 1786 gli abitanti acquistarono la loro libertà dai canonici diSallanches, dove era stato trasferito il priorato nel 1519.
Nel 1530 gli abitanti ottennero dal conte diGinevra il privilegio di tenere due fiere all'anno, mentre la valle era spesso visitata dagli ufficiali civili e dai vescovi diGinevra (prima visita registrata nel 1411, mentre SanFrancesco di Sales vi arrivò nel 1606).
Chamonix faceva parte della storica terra di Savoia emersa come territorio feudale diCasa Savoia tra l'XI e il XIV secolo. Il territorio storico è condiviso tra gli attuali Stati di Francia, Italia e Svizzera. La Casa Savoia divenne la casa reale sopravvissuta più lunga d'Europa: governò la Contea di Savoia fino al 1416 e poi il Ducato di Savoia dal 1416 al 1860.
La crescita del turismo all'inizio del XIX secolo portò alla nascita dellaCompagnie des guides de Chamonix nel 1821, per regolare l'accesso ai pendii delle montagne (che erano di proprietà comunale o cooperativa). Questa associazione deteneva il monopolio delle guide dalla città fino a quando non fu sciolta dall'azione del governo francese nel 1892; successivamente le guide dovevano essere in possesso di un diploma rilasciato da una commissione composta da funzionari e membri delClub alpino francese oltre che da residenti locali.
Dalla fine del XIX secolo in poi, lo sviluppo turistico è stato dominato da iniziative nazionali e internazionali oltre che da imprenditori locali, sebbene la comunità locale fosse sempre più dipendente e attiva nell'industria del turismo.
Nel 1916, il comune fece pressioni per cambiare il suo nome da Chamonix a Chamonix-Mont-Blanc. In seguito alla perdita del monopolio, laCompagnie si riformò come associazione di guide locali e mantenne un ruolo importante all'interno della società locale; forniva i servizi di unaassociazione di promozione sociale ai suoi membri, e nel XX secolo molti di loro erano noti alpinisti e divulgatori del turismo di montagna, in particolare il romanziereRoger Frison-Roche, il primo membro dellaCompagnie a non essere nato a Chamonix.
L'organizzazione dei primiGiochi Olimpici Invernali a Chamonix nel 1924 (dal 25 gennaio al 5 febbraio) aumentò ulteriormente il profilo di Chamonix come destinazione turistica internazionale. Durante la seconda guerra mondiale, a Chamonix operava un istituto per l'infanzia abbandonata, in cui diverse dozzine di bambini ebrei erano nascosti ai nazisti. Alcuni di coloro che li nascosero furono riconosciuti comeGiusti fra le nazioni[4].
Negli anni 1960, l'agricoltura era stata ridotta a un'attività marginale, mentre il numero di posti letto per turisti disponibili era salito a circa 60 000 entro la fine del XX secolo, con circa 5 milioni di visitatori all'anno.
«Tagliato: il primo d'azzurro, alla catena di tre monti d'argento, caricata delpeccio di verde, movente dalla partizione; il secondo di rosso, alla testa dicapriolo recisa d'oro; alla sbarra d'azzurro, caricata di cinquestelle alpine d'argento, attraversante sulla partizione.»
Da Chamonix parte la teleferica Aiguille du Midi che raggiunge l'omonima vetta e, proseguendo con la telecabina Panoramic Mont Blanc raggiunge Punta Helbronner da cui, con la funiviaSkyway Monte Bianco si scende nella frazione diEntrèves nel comune diCourmayeur, posta all'imbocco deltraforo del Monte Bianco. Il percorso si può fare in entrambi i versi, sia partendo da Chamonix sia partendo da Courmayeur. Il percorso è ben visualizzato suMont Blanc Natural Resort, il portale dedicato ai collegamenti italo-francesi.
Importante stazione sciistica è la sua localitàArgentière.